数据集概述
本数据集围绕多物种SNP标记开发的成本效益分析展开，记录了通过RAD-Seq技术结合Python管道为40种非模式物种（含植物、无脊椎动物、鱼类、哺乳动物）开发SNP标记的过程，以及18种法属圭亚那鱼类SNP标记的验证结果，包含6个相关文件。
文件详解
- README_for_Fasta_Pipelineout_nonFG_species.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：非法属圭亚那物种Fasta管道输出的说明文档，包含序列读取规则等信息
- README_for_Fasta_Pipelineout_FG_fish_species.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：法属圭亚那鱼类物种Fasta管道输出的说明文档
- FG_FishSpecies_Genotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：法属圭亚那鱼类物种的基因型数据文件
- Fasta_Pipelineout_nonFG_species.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：非法属圭亚那物种的Fasta管道输出压缩包
- Fasta_Pipelineout_FG_fish_species.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：法属圭亚那鱼类物种的Fasta管道输出压缩包
- SNPs_Validation_FG_fish_species.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：法属圭亚那鱼类物种SNP标记验证结果的压缩包
数据来源
论文“A cost-and-time effective procedure to develop SNP markers for multiple species: a support for community genetics”
适用场景
- 非模式物种SNP标记开发：为植物、无脊椎动物、鱼类、哺乳动物等非模式物种提供高效的SNP标记开发方法参考
- 群体遗传学研究：用于分析多物种群体的遗传多样性、结构及进化关系
- 成本效益分析：评估大规模SNP标记开发的经济可行性和时间效率
- 分子生态学应用：支持生态和进化相关问题的研究，如物种适应性、种群动态等
- 标记验证方法研究：为SNP标记的PCR扩增、多态性检测及Hardy-Weinberg平衡验证提供实例数据
