找到58个数据集

标签: NCBI

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  • E_MTAB_6422_PRJEB24664_Based拟南芥生命周期基因表达图谱数据

    2026年1月14日 30 40 12

    数据集概述 本数据集为拟南芥(Col-0生态型野生型)全生命周期基因表达图谱,基于RNA-Seq技术构建36个基因表达文库,覆盖幼苗、莲座叶、根、花序、花、果实荚、种子等组织部位,以及2叶期、6叶期、12叶期、衰老期等发育阶段,每个组织和发育阶段包含3个生物学重复,记录了不同年龄样本的转录程序特征。 文件详解...
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  • Triturus_Based_平衡致死系统比较基因组学研究数据_Version_1_0

    2026年1月14日 30 141 121

    数据集概述 本数据集记录了用于研究Triturus蝾螈平衡致死系统比较基因组学的生物信息学流程,包含连锁图谱、目标捕获序列、原始数据关联信息及分模块研究内容压缩包,支持对该特殊遗传系统的进化机制分析,共含4个核心文件。 文件详解 文件名称:Triturus and Lissotriton Linkage Maps.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • PRJNA388411_Based_MDS_AML患者基因变异注释分类完整数据2020

    2026年1月14日 30 193 150

    数据集概述 本数据集包含从七个公共数据集(NCBI BioProject PRJNA388411)中检测到的骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者的990个独特验证变异。数据经注释和分类处理,是血液肿瘤基因变异研究的结构化参考资料,仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:annotated and classified...
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  • Mosquito_COI_哥伦比亚安第斯山脉蚊种DNA条形码与形态学鉴定补充材料2015

    2026年1月13日 30 11 2

    数据集概述 本数据集为论文补充材料2,包含从NCBI和BOLD数据库下载的蚊类COI基因序列,用于哥伦比亚安第斯山脉三个生态系统的蚊种鉴定。序列筛选条件为长度≥480bp、无终止密码子且可与多数序列对齐,共1159条。其中蓝色标注部分为新热带区无可用序列类群的其他地理区域补充序列。 文件详解 文件名称:oo_47229.docx 文件格式:DOCX...
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  • PRJNA1167900_Source_SARS_CoV_2感染对干细胞损伤早期晚期后果研究数据

    2026年1月11日 0 181 154

    数据集概述 本数据集聚焦SARS-CoV-2感染对干细胞损伤的早期及晚期后果研究,涉及病毒通过SP-ACE2或SP-TLR4相互作用损伤造血/内皮谱系干细胞的机制,包括Nlrp3炎性小体过度激活、细胞焦亡等影响。包含3个Excel文件及相关RNAseq数据库信息,用于支持该研究假设的验证与分析。 文件详解 RNAseq数据库关联信息...
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  • VIROPLANT_Partners_Virus_Sequences_Deposited_in_NCBI

    2026年1月1日 30 30 26

    数据集概述 本数据集包含VIROPLANT项目所有合作伙伴提交并存储于NCBI的病毒序列信息,以文档形式呈现,为病毒学研究提供结构化的序列数据参考。 文件详解 文件名称:TablesViruses-Viroplant.docx 文件格式:DOCX...
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  • 非洲热带区蚜蝇属Meromacroides_Curran研究相关序列信息表

    2025年12月23日 30 144 84

    数据集概述 该数据集包含关于非洲热带区蚜蝇属Meromacroides Curran研究中,Meromacroides meromacriformis物种标本的NCBI GenBank序列信息表,记录了来自多哥和南非的标本相关数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
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  • µgreen_db光合微生物23S_rRNA基因参考数据库

    2025年12月23日 30 108 34

    数据集概述 该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库(µgreen-db),用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索,包含约两千余条23S rRNA序列,覆盖四百余种属的光合微生物,可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。 文件详解 数据库压缩包文件:...
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  • 综合抗生素药敏数据集_NCBI_ENA_BV_BRC及更多

    2025年12月22日 30 99 0

    数据集概述 该数据集整合了来自NCBI、ENA、BV-BRC等数据库的抗生素药敏数据,每条记录对应单个样本针对特定抗生素的药敏试验结果,包含14个核心字段,为抗生素耐药性研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称: antibiograms.tsv.zip 文件格式: ZIP压缩包(内含TSV文件) 字段映射: biosample: NCBI...
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  • 发酵食品微生物分离株功能注释与生物合成基因簇预测数据集

    2025年12月21日 30 58 2

    数据集概述 本数据集包含从BacDive数据库获取的约250株发酵食品来源细菌分离株基因组的分析结果,涵盖KEGG功能注释、生物合成基因簇(BGCs)预测及小ORF(smORFs)与切割肽两类肽段预测数据,为研究发酵食品微生物功能提供支持。 文件详解...
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  • 真菌与兰花间古老线粒体基因转移数据集

    2025年12月20日 30 144 67

    数据集概述 本数据集记录真菌与兰花祖先线粒体基因组间的水平基因转移(HGT)证据,包含首个真菌与被子植物线粒体基因组大规模HGT的研究数据,涉及基因序列比对、blast分析结果等,为古老跨物种基因转移研究提供支持。 文件详解 文档类文件: NCBI...
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  • 银屑病与特应性皮炎预处理和标准化转录组学数据集

    2025年12月18日 30 96 70

    数据集概述 该数据集包含从NCBI基因表达综合数据库和EBI ArrayExpress存储库获取的银屑病与特应性皮炎患者转录组学数据,经质量检查与预处理后形成标准化数据集,含39个转录组学数据集及元数据表,便于研究使用。 文件详解 文件名称: PSO_and_AD_zenodo_upload_revised.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip)...
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  • Soroseris_hookeriana复合体贝叶斯推断系统发育树补充材料2018

    2025年12月18日 30 50 3

    数据集概述 本数据集为植物学研究补充材料,包含基于核基因内转录间隔区、psbA-trnH和matK联合序列构建的贝叶斯推断50%多数规则一致树,用于展示青藏高原Soroseris hookeriana复合体的辐射演化关系。 文件详解 文件名称: oo_252441.jpg 文件格式: JPG (.jpg) 内容说明:...
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  • Nemacheilidae鳅科鱼类COI序列信息表

    2025年12月16日 30 142 16

    数据集概述 该数据集为Nemacheilidae鳅科鱼类的COI基因序列信息表,包含物种名称、分布流域、原产地国家、GenBank登录号及参考文献等信息,数据来源于NCBI GenBank数据库。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: Species: 鳅科鱼类物种名称 Drainage:...
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  • 印度西高止山脉蜻蜓目钩蜓科Merogomphus属新种系统发育研究序列列表数据集

    2025年12月15日 30 93 69

    数据集概述 本数据集为印度西高止山脉Merogomphus属新种系统发育研究的序列列表,记录了14个物种的序列信息,包括物种名称、登录号/凭证号及来源备注,支撑该类群的系统发育分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: 包含序号(Sr. No.)、物种名称(Species...
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  • 牛粪便_土壤及施肥土壤样本的111个宏基因组组装基因组数据集

    2025年12月14日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含111个宏基因组组装基因组(MAGs)的序列及相关信息,样本来源为抗生素预防下奶牛新鲜粪便、两个有机农场牧场土壤及施肥土壤构建的微宇宙。数据支持微生物组分类、功能及生态关联研究。 文件详解 文件名称: MAGs_FASTA_files.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容: 包含所有宏基因组组装基因组的FASTA序列文件...
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  • 肺炎克雷伯菌基因组分型与耐药毒力质粒数据集

    2025年12月12日 30 96 62

    数据集概述 本数据集包含61,857株肺炎克雷伯菌基因组的流行病学分析结果,涵盖多位点序列分型、荚膜及寡糖类型、CRISPR-Cas系统、克隆群、耐药基因、毒力因子及质粒复制子等关键信息,为耐药传播研究提供支持。 文件详解 综合汇总文件:...
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  • DNA存储实时数据读取数据集

    2025年12月12日 30 162 54

    数据集概述 该数据集是论文“Approaching Single-Molecule Assembly-Free Readout from Medium-Length Encoded DNA”的补充数据,包含DNA存储相关的原始数据文件、编码码字、序列及纳米孔测序原始电信号,支持DNA存储实时读取研究。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,具体说明如下:...
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  • Nebulin_SR1_SR22_Based_人类nebulin超重复序列实验数据完整数据集

    2025年12月12日 30 104 96

    数据集概述 本数据集包含人类nebulin的核苷酸和氨基酸序列文件,以及设计的SR1和SR22 nebulin超重复序列(带标签,用于克隆到表达载体),共3个PDF文件,无目录结构,为分子生物学实验提供序列参考。 文件详解 文件名称:Sekwencja aminokwasowa i nukleotydowa ludzkiej nebuliny...
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