MRSA_t003_Based卢森堡及欧洲优势克隆株系统分型研究数据

数据集概述

本数据集为卢森堡及欧洲优势MRSA克隆株t003的系统分型研究数据,包含14个实时PCR分型检测方法的开发与验证结果,以及全基因组SNP分型(WGST)分析数据,可用于提升MRSA优势克隆株的亚型区分能力,支持流行病学传播分析。

文件详解

  • 文件名称:README_for_trees_data_dryad.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含数据集说明文档,说明每个系统发育树对应3类文件(MEGA树会话.mts文件、SNP矩阵.fas文件、SNP矩阵Excel文件),并提供NCBI生物项目PRJNA206507的测序数据链接。
  • 文件名称:trees_data_dryad.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包文件,包含系统发育分析相关的树会话文件、SNP矩阵文件等数据。

适用场景

  • MRSA分子分型技术优化: 用于验证基于can-SNP的PCR分型方法对优势克隆株t003的亚型区分能力。
  • 医院感染流行病学调查: 分析长期护理机构(LTC)等场景中MRSA的传播簇,支持暴发溯源。
  • 欧洲MRSA克隆株监测: 为西欧其他地区t003型MRSA的亚型分析提供可适配的检测工具。
  • 微生物基因组学研究: 对比全基因组SNP分型与传统分型方法的分辨率差异,优化分型策略。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.52 MiB
最后更新 2026年1月25日
创建于 2026年1月25日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。