数据集概述
本数据集包含研究论文“Gut microbiota structure differs between honey bees in winter and summer”的相关数据与代码，涉及qPCR原始数据、扩增子测序数据处理及统计分析。涵盖4组蜜蜂肠道菌群实验数据及对应分析代码，共21个文件，支持蜜蜂肠道菌群季节差异研究的复现与拓展分析。
文件详解
- 数据文件（.csv、.xlsx）
- 文件名称：包括0_df_mm.csv、0_df_pool.csv、0_df_exp.csv、0_df_ind.csv、03_df_sampleinfo.csv等12个.csv文件及01_datasets.xlsx
- 文件格式：.csv、.xlsx
- 字段映射介绍：包含蜜蜂样本信息（Sample_ID、Hive、Date、Bee_type等）、qPCR原始数据（Cq、SD、actin_Cq等）、计算衍生数据（CopyNum、CellNum、CopyNum_norm等）及16S系统发育数据（03_df_16S_phylo.csv）
- 代码文件（.R）
- 文件名称：2_Dada2_Pipeline.R、3_Plots_Figures_1_S1_S2_S3.R等7个.R文件
- 文件格式：.R
- 内容介绍：涵盖Dada2扩增子分析流程、论文图表绘制代码及统计分析代码
- 文档文件（.txt）
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：.txt
- 内容介绍：数据集说明文档，描述数据文件对应实验内容及代码用途
数据来源
ISME论文“Gut microbiota structure differs between honey bees in winter and summer”，短读数据集可通过NCBI Bioproject PRJNA578869获取
适用场景
- 蜜蜂肠道微生物组季节差异分析: 利用qPCR原始数据及测序分析代码，研究冬夏季蜜蜂肠道菌群结构变化
- 微生物实验数据处理方法研究: 参考Dada2流程及统计分析代码，优化微生物组数据处理与可视化方法
- 蜜蜂生理生态关联研究: 结合样本信息与菌群数据，分析肠道菌群与蜜蜂季节适应性的关系
- 微生物组实验复现与验证: 基于提供的原始数据和代码，复现论文研究结果并开展拓展验证
