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ProtNAff_Based_蛋白质结合核酸过滤及片段库完整数据
2026年1月28日 30 160 134
数据集概述 本数据集是通过ProtNAff pipeline生成的蛋白质结合核酸相关数据，包含2021年10月筛选的蛋白质-RNA结构元数据、三核苷酸片段列表及坐标库。筛选条件为含蛋白质和RNA链、无DNA、分辨率小于3埃或NMR方法的PDB结构，排除核糖体，用于支持原ProtNAff论文分析。 文件详解 核心数据文件...
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PDB_2xtt_Based_PDB结构2xtt成对ADP距离过滤数据
2026年1月22日 30 151 136
数据集概述 本数据集包含PDB结构2xtt中低于阈值的成对ADP距离信息，涵盖欧氏距离、黎曼距离等8种距离计算方式，并过滤掉黎曼距离高于0.8的记录，为蛋白质结构分析提供结构化的距离数据支持。 文件详解 文件名称：distances_totalall_2xtt_filtered.xlsx 文件格式：XLSX...
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SAMPL9_Based_甲苯水分配系数NE_FG盲预测ORAC6_1数据
2026年1月21日 30 133 56
数据集概述 本数据集为SAMPL9挑战中甲苯/水分配系数（LogP）的非平衡快速增长（NE-FG）盲预测复现数据，基于s/w ORAC6.1工具构建，包含电荷参数库、分子结构文件、工作数据目录、辅助脚本及挑战提交分析结果等内容。 文件详解 核心目录结构： lib-631Gd：含6-31Gd电荷的GAFF2 ORAC拓扑参数库 lib-...
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MD_Files_Based_FSHR和LHCGR糖蛋白受体SDPC脂质轨迹数据
2026年1月15日 30 42 25
数据集概述 本数据集包含糖蛋白受体FSHR和LHCGR在SDPC脂质中轨迹的MD文件，涵盖PSF、PDB结构文件及charmm36m力场参数文件。PDB与trr文件仅保留主链原子，所有帧均已拟合至跨膜结构域。数据集共15个文件，支持生物分子动力学模拟相关研究。 文件详解 结构文件包...
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pLMs_Evolutionary_Information_蛋白质语言模型进化信息数据集
2026年1月13日 30 12 0
数据集概述 本数据集用于测试进化信息与蛋白质语言模型嵌入结合对二级结构预测的影响，以PDB结构为真值，经PDBredo DB和CATH交叉验证，包含296,596条蛋白质链序列，分TEST100、VAL100、TRAIN6727三个子集，提供序列、二级结构注释、无序区域标注、MSA、PSSM及元文件等资源。 文件详解 验证集注释文件...
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Melittin_Recombinant_Based同位素标记蜂毒肽重组表达与化学酰胺化研究数据_SI
2026年1月2日 30 43 41
数据集概述 本数据集为蜂毒肽（Melittin）相关研究的补充数据，包含7个补充表格和25个PDB结构文件，记录了阳离子膜裂解肽列表、蜂毒肽骨架化学位移、15N-1H耦合参数、AlphaFold模型与RDC数据的拟合分析结果，以及实验涉及的蛋白质原子坐标，支撑同位素标记蜂毒肽的重组表达与化学酰胺化研究。 文件详解 表格文件（Excel格式）...
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O_Buß与S_Jager补充数据集_β_酮酯酶水解HTS测定的统计评估
2025年12月25日 30 1 0
数据集概述 本数据集是O.Buß与S.Jager关于β-酮酯酶水解高通量筛选（HTS）测定统计评估研究的补充数据，包含计算用PDB结构文件、统计分析R脚本、活性测定校准数据及实验用酶的SDS-PAGE凝胶图片，为相关研究提供原始数据支持。 文件详解 该数据集包含5个文件，具体说明如下： - 统计分析R脚本压缩包: - 文件名称:...
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酵母拓扑异构酶1与Rpc82交互作用数据集
2025年12月18日 30 186 128
数据集概述 该数据集围绕酵母拓扑异构酶1（yTop1）与Rpc82蛋白的交互作用展开，包含分子结构模型、分子对接及模拟相关数据，为研究二者相互作用机制提供支持。 文件详解 README.txt：文本格式，说明数据与软件可用性，介绍各压缩包内的分子结构、模型质量评估等文件内容。...
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Holozoa远缘分支p53家族同源物表征补充材料
2025年12月15日 30 31 0
数据集概述 本数据集为《Holozoa远缘分支p53家族同源物表征》文章的补充材料，包含13个文件，涉及p53家族同源物的结构预测、序列比对、进化分析等结果，支持研究p53家族的古老起源。 文件详解 PDF文件（10个）： 如Supplementary material 08 p-values of all domain hits in non-...
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唾液酸酶结构支架突变轨迹相关数据集
2025年12月15日 30 104 59
数据集概述 本数据集包含与唾液酸酶结构支架突变轨迹相关的模拟数据，围绕野生型及H349A/Q350Y突变体的反转与保留反应机制展开，涵盖经典分子动力学和量子力学/分子力学模拟的输入文件、拓扑结构、坐标及关键状态结构等内容。 文件详解 该数据集包含以下文件，具体说明如下： - 文件名称：README.txt - 文件格式：TXT (.txt) -...
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p53_REACT项目基因设计与大肠杆菌转化数据集
2025年12月13日 30 90 74
数据集概述 本数据集为p53-REACT项目第一步研究成果，聚焦基因亚克隆与大肠杆菌转化关键节点，通过3份PDF文件呈现基因设计图谱及相关分析结果，支撑项目目标1的研究推进。 文件详解 文件名称：Fasta pdb 13-10_p53ref_analog.pdf 文件格式：PDF...
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pHLA_I分子中肽构象灵活性建模数据集
2025年12月11日 30 135 1
数据集概述 本数据集为研究pHLA-I分子中肽构象灵活性的机器学习建模提供支持，包含用于同源建模和集合生成的PDB结构及序列数据，以压缩包形式存储。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: database.zip - 文件格式: ZIP (.zip) - 文件内容:...
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DNATCO_v5_0三维核酸结构分析平台补充数据集
2025年12月9日 30 199 104
数据集概述 本数据集是DNATCO v5.0三维核酸结构分析平台的补充数据，包含3个示例PDB结构的注释文件、验证报告、约束文件、核心结构处理库源代码快照及离线CLI版本，为平台功能验证与本地化使用提供支持。 文件详解 该数据集包含3个压缩文件，具体说明如下： -...
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纤维素活性AA10多糖单加氧酶氧化酶活性机制相关PDB结构数据集
2025年12月7日 30 138 42
数据集概述 本数据集包含论文《纤维素活性AA10多糖单加氧酶氧化酶活性机制》相关的PDB格式结构文件，主要为QM/MM优化后的所有中间体及过渡态结构，涵盖QM区域与完整酶结构。 文件详解 文件名称: pdbs.zip 文件格式: .zip（压缩包） 内容说明:...
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疱疹病毒蛋白长期与短期演化的功能和结构决定因素数据集
2025年12月4日 30 30 16
数据集概述 本数据集包含疱疹病毒（HSV1、HCMV、KHSV）编码基因相关的系统发育树、多序列比对、PDB结构及质谱文件，支持研究其蛋白演化的功能与结构决定因素。 文件详解 该数据集包含5个ZIP格式压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: INTERSPECIES_TREES.zip - 文件格式: ZIP - 内容:...
