数据集概述
本数据集为蜂毒肽(Melittin)相关研究的补充数据,包含7个补充表格和25个PDB结构文件,记录了阳离子膜裂解肽列表、蜂毒肽骨架化学位移、15N-1H耦合参数、AlphaFold模型与RDC数据的拟合分析结果,以及实验涉及的蛋白质原子坐标,支撑同位素标记蜂毒肽的重组表达与化学酰胺化研究。
文件详解
- 表格文件(Excel格式)
- 文件名称:RecExpChemAmMel_SI.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含7个补充表格,核心内容如下:
- Table S1:含C端酰胺化修饰的阳离子膜裂解及抗菌肽代表列表
- Table S2:同位素标记蜂毒肽的骨架化学位移数据(含氘同位素及压力校正)
- Table S3:蜂毒肽的15N-1H各向同性J耦合、各向异性耦合及残余偶极耦合数据(单位:Hz)
- Table S4:AlphaFold-Multimer模型与Pf1介质中RDC数据的拟合分析结果(含RMSD值)
- Table S5:AlphaFold-Multimer模型与聚丙烯酰胺凝胶介质中RDC数据的拟合分析结果
- Table S6:基于两种介质RDC数据的蜂毒肽结构模型排名
- Table S7:2MLT晶体结构及AlphaFold-Multimer模型的原子坐标处理信息(含C端修饰说明)
- 结构文件(PDB格式)
- 文件名称:2mlt.pdb、af1.pdb至afr5.pdb等25个文件
- 文件格式:PDB
- 字段映射介绍:存储实验涉及的蛋白质原子坐标,包括2MLT晶体结构、AlphaFold-Multimer预测的蜂毒肽模型及相关衍生结构的原子空间位置信息
适用场景
- 膜活性肽结构功能研究: 分析含C端酰胺化修饰的阳离子肽列表及蜂毒肽的结构参数,探究其膜裂解活性机制
- 蛋白质核磁共振数据分析: 利用化学位移、耦合参数等数据,研究同位素标记蜂毒肽的溶液构象
- 计算结构生物学验证: 对比AlphaFold模型与实验RDC数据的拟合结果,评估AI预测结构的准确性
- 蛋白质结构修饰研究: 分析不同C端修饰对蜂毒肽结构的影响,支撑化学酰胺化修饰策略优化