数据集概述
本数据集为《Holozoa远缘分支p53家族同源物表征》文章的补充材料,包含13个文件,涉及p53家族同源物的结构预测、序列比对、进化分析等结果,支持研究p53家族的古老起源。
文件详解
- PDF文件(10个):
- 如Supplementary material 08 p-values of all domain hits in non-metazoan p53 homologs.pdf:非后生动物p53同源物所有结构域命中的p值数据
- 如Supplementary material 12 FASTA sequences of eleven non-Metazoan p53 family homologous sequences and twenty-seven other representative closest relative Metazoan species for protein tree construction.pdf:11条非后生动物p53家族同源序列及27个代表性后生动物近缘物种的FASTA序列(用于构建蛋白树)
- 如Supplementary material 13 Protein tree MrBayes.pdf:MrBayes构建的蛋白树结果
- TXT文件(2个):
- Supplementary material 04 Predicted PDB structures using SWISS-MODELL.txt:SWISS-MODELL预测的p53家族同源物PDB结构数据
- Supplementary material 03 Predicted PDB structures using QUARK ab initio prediction.txt:QUARK从头预测的PDB结构数据
- XLSX文件(1个):
- Supplementary material 02 Reciprocal phhmer search for homologs validation.xlsx:同源物验证的 reciprocal phhmer搜索结果
适用场景
- 进化生物学研究:分析p53家族蛋白的古老起源与进化历程
- 结构生物学研究:探究远缘物种p53同源物的结构特征及与人类p53的相似性
- 分子生物学研究:验证非后生动物p53同源物的结构域功能及序列保守性
- 生物信息学分析:参考同源序列比对、蛋白树构建等方法与结果