找到17个数据集

标签: RNAseq

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  • 甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集

    2025年12月12日 30 61 7

    数据集概述 本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据,包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件,支持论文结论的验证与扩展分析。 文件详解 数据文件(CSV格式,共26个):...
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  • 黑腹果蝇交配后反应相关基因重分析数据集

    2025年12月12日 30 110 18

    数据集概述 本数据集是对黑腹果蝇雌性两种组织类型交配前后基因表达数据集的重分析结果,包含4种并行分析流程的对比,识别出未被先前研究发现的交配后反应相关基因,探讨RNA-seq分析技术的优化方向。 文件详解 说明文档与协议文件: README.md:Markdown格式,数据集说明文档 LICENSE:无扩展名,许可协议文件 图表文件(PDF格式):...
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  • IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本

    2025年12月12日 30 209 179

    数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本文件、NGS测序文库质控报告及参考基因组文件,为该实验的转录组数据分析提供了完整的计算流程支持。 文件详解 分析脚本文件(.sh格式,共3个): 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh:用于构建STAR比对索引的脚本...
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  • edgeR的简化代表性亚硫酸氢盐测序差异甲基化分析数据与代码

    2025年12月11日 30 11 9

    数据集概述 本数据集包含小鼠乳腺上皮细胞群体的简化代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)甲基化谱与RNA-seq表达谱,以及用于差异甲基化分析的R代码,支持F1000Research发表的相关研究文章。 文件详解 该数据集包含11个文件,具体说明如下: - 甲基化测序数据文件(.gz格式): -...
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  • 甘薯基因型RNA_seq基因鉴定与类胡萝卜素生物合成挖掘研究表1数据集

    2025年12月10日 30 108 34

    数据集概述 本数据集为甘薯基因型RNA-seq基因鉴定与类胡萝卜素生物合成挖掘研究中的表1数据,核心内容是组装转录本和单基因的长度分布统计,包含不同长度区间的数量、总长度、N50等关键指标。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 核心内容:...
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  • 甘薯基因型RNA_seq基因鉴定与类胡萝卜素生物合成分析表2数据集

    2025年12月9日 30 90 63

    数据集概述 该数据集包含甘薯两个基因型RNA-seq基因鉴定研究中的表2数据,核心内容为甘薯unigenes(转录本)的功能注释统计结果,涵盖不同数据库的注释数量及占比,为类胡萝卜素生物合成分析提供基础数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 内容说明:...
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  • 小立碗藓SMG1基因缺失对质量控制通路影响研究数据集

    2025年12月9日 30 209 95

    数据集概述 本数据集基于RNA-seq和机器学习方法,研究小立碗藓(Physcomitrella patens)中SMG1基因在mRNA、DNA及蛋白质质量控制通路中的作用,包含转录组分析、表型数据及相关代码文件,为植物质量控制过程研究提供数据支持。 文件详解...
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  • Coccomyxa_elongata_SAG_216_3b_Based_藻类测序数据FastQC质量分析完整数据

    2025年12月9日 30 30 6

    数据集概述 本数据集包含淡水藻类Coccomyxa elongata SAG 216-3b的测序数据FastQC质量报告,涵盖PacBio Hifi、ONT、Hi-C及RNAseq四种测序类型的质控结果,用于支撑其染色体级基因组组装与注释研究。 文件详解 测序类型FastQC报告文件(共6个,均为.html格式):...
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  • TDP_43核缺失导致额颞叶痴呆与肌萎缩侧索硬化症选择性多聚腺苷酸化变化数据集

    2025年12月9日 30 60 27

    数据集概述 本数据集围绕额颞叶痴呆(FTD)与肌萎缩侧索硬化症(ALS)中TDP-43核缺失引发的选择性多聚腺苷酸化(APA)变化展开,包含实验检测的基因APA变化数据、患者信息及相关实验材料与代码,为研究TDP-43病理机制提供支持。 文件详解 补充材料压缩包:...
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  • 小肠神经内分泌肿瘤基因组与转录组支持数据集

    2025年12月8日 30 137 85

    数据集概述 该数据集是论文《Small intestinal neuroendocrine tumors lack early genomic drivers, acquire DNA repair defects and harbor hallmarks of low REST...
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  • ARCHS4_Based_DeepSeqDock支撑信息分析完整数据

    2025年12月8日 30 201 47

    数据集概述 本数据集是DeepSeqDock系统测试用数据集的支撑信息,包含探索性数据分析报告及CSV文件,数据子集源自ARCHS4数据集,相关元数据来自Ma'ayan实验室平台或NCBI数据库,为理解DeepSeqDock系统测试数据提供支持。 文件详解...
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  • Maximillian_R_W_Jones博士论文补充数据集

    2025年12月8日 30 151 89

    数据集概述 本数据集是Maximillian R. W. Jones博士论文的补充数据集合,涵盖论文第2、3、4章的配套数据与文档。包含基因型、代谢物、表型、基因表达、实验设计等多类型数据,支持论文研究结果的验证与扩展分析。 文件详解 该数据集包含22个文件,按章节分类说明如下: - 第2章补充数据: - Supplementary_Data_2.1:...
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  • 间质雄激素受体在沃尔夫管发育中的关键作用数据集

    2025年12月8日 30 9 3

    数据集概述 该数据集围绕间质雄激素受体(AR)在小鼠沃尔夫管发育中的作用展开,通过间质特异性AR敲除模型(ARcKO)研究其对沃尔夫管维持、分化及形态发生的影响,包含实验结果相关的补充图表及说明文档。 文件详解 文件名称: README.md,文件格式: Markdown 内容: 数据集概述、文件结构说明及补充图表(如Supplementary...
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  • 剪接调控学习模型数据集

    2025年12月8日 30 4 3

    数据集概述 本数据集包含通过KATMAP方法从剪接因子(SF)扰动RNA-seq实验中学习到的剪接调控模型,涵盖不同剪接事件类型的模型文件、推理结果及靶标预测表,为研究剪接因子调控机制提供数据支持。 文件详解...
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  • 拟南芥MDF基因调控RNA剪接与基因表达的RNA_seq和RT_qPCR数据集

    2025年12月7日 30 137 104

    数据集概述 本数据集包含拟南芥中MERISTEM-DEFECTIVE(MDF)基因调控RNA剪接与基因表达的RNA-seq和RT-qPCR实验数据,涉及根分生组织功能相关转录本的剪接分析、胁迫响应下的异构体积累及核质穿梭等内容,为研究MDF在分生组织干细胞维持和基因表达调控中的作用提供支持。 文件详解 核心数据文件(.xlsx格式,共30个):...
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  • 人胚胎干细胞体外肝细胞分化编码基因表达矩阵数据集

    2025年12月5日 30 201 65

    数据集概述 该数据集为人胚胎干细胞(hESCs)体外肝细胞分化过程的编码基因表达矩阵,涵盖未分化hESC、肝谱系定型及成熟肝细胞等多个发育阶段的基因表达值,支持干细胞分化与肝细胞发育研究。 文件详解 文件名称:ES-liver differentiation RNA-seq-Coding gene.zip 文件格式:ZIP压缩包(.zip)...
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  • 外源性化学物暴露大鼠肝脏长非编码RNA调控网络数据集

    2025年12月4日 30 102 57

    数据集概述 本数据集围绕外源性化学物暴露对大鼠肝脏长非编码RNA(lncRNA)调控网络的影响展开,包含通过RNA-seq技术分析27种不同作用机制化学物处理后,大鼠肝脏中lncRNA与蛋白编码基因的表达及相互作用数据,为研究外源性化学物的转录组干扰效应提供支持。 文件详解 转录组结构文件:...
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