数据集概述
本数据集通过RNA-seq技术构建柑橘粉虱转录组数据库，筛选其感染玫烟色拟青霉后的免疫相关基因，包括模式识别受体、信息转导因子等129个免疫相关基因，以及441个差异表达基因，并通过qRT-PCR验证结果，为柑橘粉虱微生物防治提供靶基因参考。
文件详解
- E01_vs_E02.annotation.xls：XLS格式，包含E01与E02样本的基因注释信息
- SSR upload.xls：XLS格式，用于SSR分析的上传数据文件
- RPKM of CG and TG.zip：ZIP格式压缩包，包含CG和TG样本的RPKM表达量数据
- The results of qRT-PCR for validated genes.xlsm：XLSM格式，经qRT-PCR验证的基因表达结果数据
- Whitefly.Unigene.fa：FA格式，柑橘粉虱的unigene序列文件
- Whitefly.Unigene.cds.fa：FA格式，柑橘粉虱unigene对应的CDS序列文件
适用场景
- 昆虫免疫学研究：分析柑橘粉虱感染病原真菌后的免疫基因表达调控机制
- 农业害虫防治靶标筛选：基于差异表达免疫基因开发柑橘粉虱微生物防治策略
- 转录组数据分析：利用unigene序列及注释信息开展柑橘粉虱功能基因组研究
- 基因表达验证：结合qRT-PCR结果验证RNA-seq差异表达基因的可靠性
- 分子标记开发：通过SSR数据挖掘柑橘粉虱的简单重复序列分子标记
