数据集概述
本数据集包含白足鼠（Peromyscus leucopus）和小鼠（Mus musculus）经脂多糖（LPS）或生理盐水处理后，血液、脾脏和肝脏组织的差异表达基因信息。通过RNA-seq分析两种啮齿动物对炎症刺激的基因表达响应，探究动物对人畜共患病原体感染的耐受机制。数据集含2个文件，记录实验设计与差异基因列表。
文件详解
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集标题、作者信息（主要研究者Alan Barbour及所属机构加州大学欧文分校）、实验设计概述（动物处理方式、样本采集时间与组织类型）等元数据，生成时间为2021年3月1日。
- 文件名称：Table1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录RNA-seq分析得到的差异表达基因列表，涉及白足鼠与小鼠在LPS或生理盐水处理后的基因表达差异数据，支撑基因、通路及网络水平的差异表达分析。
数据来源
University of California Irvine（Alan Barbour团队）
适用场景
- 动物感染耐受性机制研究：分析白足鼠与小鼠对LPS炎症刺激的基因表达差异，探究人畜共患病原体宿主耐受的分子机制。
- 炎症响应基因通路分析：基于差异表达基因数据，研究两种啮齿动物炎症相关通路（如细胞因子通路、中性粒细胞活性通路）的激活差异。
- 巨噬细胞极化研究：通过精氨酸酶1/一氧化氮合酶2、IL-10/IL-12等基因的表达二分性，分析M1/M2型巨噬细胞极化在不同物种中的差异。
- 比较免疫学研究：对比白足鼠（自然宿主）与小鼠（实验室模型）对炎症刺激的免疫响应差异，为 zoonosis 研究提供参考。
