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标签: Snakemake

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  • RNA_sequencing_Based_RNA测序分析数据集

    2026年1月29日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含16个与RNA测序分析相关的文件，涵盖分析脚本、配置文件、样本数据、基因集等内容，涉及Rotenone和Hpy两种实验条件下的神经元RNA测序样本信息，可用于RNA测序数据的处理、分析及可视化。 文件详解 代码文件...
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  • ArXiv_Publication_Based出版物版本发布日期查询表数据

    2026年1月21日 30 206 60

    数据集概述 本数据集包含纯JSON格式的查询表，用于将ArXiv出版物版本标识符映射到对应的发布日期。JSON文件归档于压缩包中，按标识符的日期前缀命名，例如1908.json对应含1908前缀的版本标识符。数据集还包含工作流归档文件、文件名称列表JSON及说明文档，总计四个文件，支持数据可重复性验证。 文件详解 归档数据文件 文件名称：arxiv-...
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  • DMY_Based_RNA_Seq与small_RNA_Seq处理文件及分析代码数据

    2026年1月18日 30 81 8

    数据集概述 本数据集包含DMY相关RNA-Seq和small RNA-Seq的处理文件与分析代码，涉及基因与miRNA的计数、表达量（FPKM/RPM）、差异分析结果及可视化脚本等，支持生物医学领域基因表达相关研究，共15个文件。 文件详解 基因表达数据文件...
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  • Taverna工作流转换为Snakemake工作流的案例数据集

    2025年12月15日 30 133 70

    数据集概述 该数据集记录了将非功能性Taverna工作流转换为Snakemake工作流的过程，关键阶段融入大语言模型，包含原始废弃工作流、转换后工作流及相关制品，Jupyter笔记本详述各步骤。 文件详解 文件名称: Workflow_Revival_Uses_Case_ipynb (1).ipynb 文件格式: .ipynb 内容说明:...
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  • Viridian共识序列与元数据2024_10_14

    2025年12月9日 30 13 11

    数据集概述 该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包，包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列，并转换为VCF Zarr格式，以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。 文件详解 文件名称：viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip...
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