Viridian共识序列与元数据2024_10_14

数据集概述

该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包，包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列，并转换为VCF Zarr格式，以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。

文件详解

• 文件名称：viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip
• 文件格式：ZIP压缩包
• 内容说明：包含使用MAFFT v7.475对齐至Wuhan-Hu-1/2019参考序列的共识序列，以及对应的元数据，所有数据已转换为VCF Zarr格式

适用场景

• 病毒基因组学研究：分析SARS-CoV-2病毒序列的变异特征与进化趋势
• 生物信息学工具开发：测试VCF Zarr格式在病毒序列数据存储与访问中的性能
• 流行病学分析：结合元数据探究病毒传播模式与地域分布规律
• 可重复研究实践：基于提供的Snakemake pipeline复现数据处理流程