找到17个数据集

标签: 共识序列

过滤结果
  • HBV_Based病毒基因组序列比对方法研究数据

    2026年2月1日 30 149 77

    数据集概述 本数据集包含用于比较HBV序列比对方法的相关数据,涉及全自动序列比对方法与传统方法的性能对比。数据涵盖HBV全基因组及片段序列的比对结果、系统发育树、基因型分析等内容,共13个文件,可用于研究不同比对方法对系统发育分析的影响及HBV基因型分类。 文件详解 文档文件 文件名称:hbv_suppinfo_commands.docx...
    packageimg
  • 基于地中海欧洲树木区系属级DNA序列数据的系统发育信号分析

    2026年1月30日 30 49 36

    数据集概述 本数据集包含地中海欧洲64个树木属的matK、rbcL、trnH-psbA三个基因的共识DNA序列,遵循Médail等人2019年的清单,用于构建属级时间校准系统发育树及评估脆弱性,支持相关植物学研究。 文件详解...
    packageimg
  • Psoralea_Based_豆科Psoralea属分类学研究数据集

    2026年1月25日 30 35 26

    数据集概述 本数据集是豆科Psoralea属分类学研究的配套文件,包含系统发育分析相关的样本信息、数据处理结果及进化树文件。数据支撑Psoralea属的分类修订研究,涵盖样本ENA登录号、缺失数据与旁系同源基因统计、位点共识序列、比对序列、基因树及物种树等内容,共7个文件。 文件详解 1_Appendix...
    packageimg
  • GTN_Training_Galaxy平台ENA数据上传教程训练数据

    2026年1月23日 30 19 16

    数据集概述 本数据集是Zenodo.3732359数据的子集,用于Galaxy培训网络(GTN)的“Upload data to ENA”教程。已按指定流程移除人类序列痕迹,包含基于Illumina PE数据生成的SARS-CoV-2共识序列及相关原始数据,共8个文件。 文件详解 数据文件...
    packageimg
  • Szulkin_Stacks_Based地中海蓝山雀栖息地种群基因组分化数据

    2026年1月20日 30 106 85

    数据集概述 本数据集为地中海蓝山雀栖息地种群基因组分化研究数据,包含197个个体的12106个SNP位点信息,通过RAD-Seq技术分析落叶与常绿橡树林栖息地种群的遗传结构,揭示地理距离与栖息地类型对遗传变异的影响,支持表型-基因型关联研究。 文件详解 原始未过滤SNP数据文件...
    packageimg
  • Larsen_etal_2016_Based_马达加斯加狐猴血液转录组病原数据

    2026年1月20日 30 204 18

    数据集概述 本数据集基于马达加斯加两种极危野生狐猴(大狐猴和冕狐猴)的血液转录组非靶向深度测序结果,包含未描述的媒介传播寄生虫共识序列,用于发现狐猴种群中潜在的新型人兽共患病原,支持“同一世界,同一健康”框架下的传染病研究。 文件详解 文件名称:Larsen_etal_2016_ConsensusSequences.zip...
    packageimg
  • Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据

    2026年1月18日 30 132 118

    数据集概述 本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果,包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本,可支持物种系统发育与种群遗传学研究,共6个文件。 文件详解 序列比对文件 文件名称:Alignment_for_RAxML.phy 文件格式:PHY...
    packageimg
  • Mesodesma_donacium_SNP_Based_基因注释与多态性分析数据

    2026年1月15日 30 200 62

    数据集概述 本数据集围绕软蛤Mesodesma donacium的表达序列标签(EST)数据展开,通过454焦磷酸测序生成180159条EST,经从头组装得到10178个contigs和41765个singletons,最终发现2594个SNP位点,涉及613条共识序列,还包含基因本体(GO)分析及SNP验证相关信息,为该物种遗传研究提供基础数据。...
    packageimg
  • Arabidopsis_lyrata_SI_Source_植物自交不亲和性与交配系统转变研究数据

    2026年1月8日 30 95 64

    数据集概述 本数据集围绕北美Arabidopsis lyrata自交不亲和性(SI)的种内崩溃及交配系统向自交转变展开研究,验证S位点单倍型与SI丧失的关联、种群瓶颈的作用及SI丧失的突变位置。通过多种基因分型方法,结合经典遗传学与深度测序分析,揭示自交亲和性(SC)的遗传机制,为进化生物学中交配系统转变问题提供数据支持。 文件详解 文档文件...
    packageimg
  • RAD_sequencing_Zebra_Finch_Genome_留尼汪灰绣眼鸟SNP标记数据

    2026年1月8日 30 136 3

    数据集概述 本数据集通过RAD测序技术结合与斑胸草雀基因组比对,为非模式雀形目鸟类留尼汪灰绣眼鸟生成大量SNP标记。研究使用6个混合样本池测序,构建约60万个contigs,其中38.6万个可比对至斑胸草雀基因组,最终获得8万余个可准确定位且分布均匀的SNP标记,展示了该方法在非模式鸟类中高效开发SNP的潜力。 文件详解...
    packageimg
  • Bt玉米与土壤空间异质性对丛枝菌根真菌影响数据集

    2025年12月21日 30 112 60

    数据集概述 本数据集围绕Bt转基因玉米与非Bt玉米对丛枝菌根真菌(AMF)群落及植物生长的影响展开,重点对比土壤空间异质性与Bt基因修饰的作用差异。包含植物生长指标、AMF定殖率及群落组成数据,通过454焦磷酸测序分析根内AMF多样性,揭示田间空间异质性对AMF群落结构的主导影响。 文件详解 图表与图像文件: Figure S1 Plot...
    packageimg
  • InstaNexus通用直接蛋白质测序补充数据集

    2025年12月18日 30 153 88

    数据集概述 本数据集是论文《Generalizable direct protein sequencing with InstaNexus》的补充数据,包含InstaNexus软件在不同测试样本类型上的输出结果,以及复现论文图表所需的必要数据,按样本类型组织并标注了运行参数。 文件详解 文件名称:supplementary_data.zip...
    packageimg
  • 澳大利亚无垫蜂属_膜翅目_蜜蜂科_条蜂族_修订补充材料1

    2025年12月12日 30 157 81

    数据集概述 本数据集为澳大利亚无垫蜂属(Amegilla)分类修订研究的补充材料,包含系统发育树与DNA凭证编号表(含GenBank登录号),支持对Notomegilla和Zonamegilla亚属的分类学分析。 文件详解 文件名称: oo_121868.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
    packageimg
  • Viridian共识序列与元数据2024_10_14

    2025年12月9日 30 194 100

    数据集概述 该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包,包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列,并转换为VCF Zarr格式,以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。 文件详解 文件名称:viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip...
    packageimg
  • ARTIC_RSV扩增子测序全球RSV基因型动态数据集

    2025年12月9日 30 62 38

    数据集概述 本数据集包含ARTIC RSV扩增子测序研究中生成的全球RSV基因型动态相关共识序列,以及两张补充图和两张补充表的扩展数据,支持对RSV基因型全球变化的分析。 文件详解 文档文件: Supplemental Figure 1.pdf:PDF格式,补充图1,提供研究相关的可视化结果 Supplemental Figure...
    packageimg
  • Earl_Grey转座元件注释分析管道补充文件数据集

    2025年12月6日 30 40 11

    数据集概述 本数据集是Earl Grey转座元件注释分析管道的配套补充文件,包含参数选择说明、模拟基因组配置、参考注释、补充表格及结果图表等7个文件,为该自动化分析工具的使用与验证提供支持。 文件详解 文件名称: additionalFile1_BEATparameterSelection.docx 文件格式: DOCX (.docx) 内容说明:...
    packageimg
  • 啤酒花着丝粒重复序列与反转录转座子动态模式数据集

    2025年12月4日 30 82 8

    数据集概述 本数据集聚焦啤酒花(Humulus lupulus L.)着丝粒区域的重复序列与反转录转座子动态模式,包含CENH3抗体设计原始数据、着丝粒重复序列共识序列及重复组分析结果,为研究啤酒花着丝粒结构提供基础数据。 文件详解 文件名称: index.html,文件格式: HTML,内容:...
    packageimg