啤酒花着丝粒重复序列与反转录转座子动态模式数据集

数据集概述

本数据集聚焦啤酒花(Humulus lupulus L.)着丝粒区域的重复序列与反转录转座子动态模式,包含CENH3抗体设计原始数据、着丝粒重复序列共识序列及重复组分析结果,为研究啤酒花着丝粒结构提供基础数据。

文件详解

  • 文件名称: index.html,文件格式: HTML,内容: 啤酒花Saaz雌性与Lib雄性样本的重复组(repeatome)分析结果。
  • 文件名称: Fasta alignment of Humulus lupulus CENH3 sequences.fasta,文件格式: FASTA,内容: 啤酒花CENH3序列的多序列比对数据。
  • 文件名称: CENH3_S1.fasta,文件格式: FASTA,内容: 啤酒花CENH3抗体设计所用的原始数据序列。
  • 文件名称: Satellite consensus sequences.fasta,文件格式: FASTA,内容: 用于引物设计的着丝粒卫星重复序列共识序列。

适用场景

  • 植物分子遗传学研究: 分析啤酒花着丝粒区域重复序列的组成与动态变化。
  • 分子标记开发: 基于着丝粒重复序列共识序列设计物种特异性分子标记。
  • 染色体结构研究: 探究反转录转座子在啤酒花着丝粒功能维持中的作用。
  • 抗体设计验证: 支持啤酒花CENH3蛋白抗体的设计与靶向性验证研究。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.95 MiB
最后更新 2025年12月4日
创建于 2025年12月4日
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