数据集概述
该数据集是一个针对23S rRNA基因的参考数据库（µgreen-db），用于光合微真核生物和原核蓝细菌群落的分类学分析。数据来源于NCBI、SILVA、CRW数据库及递归BLAST搜索，包含约两千余条23S rRNA序列，覆盖四百余种属的光合微生物，可实现土壤DNA宏条形码序列的高比例属水平分类分配。
文件详解
- 数据库压缩包文件：
- 文件名称：microgreen-db_v1.0.zip、microgreen-db_v1.1.zip、microgreen-db_v1.2.zip
- 文件格式：ZIP压缩包（.zip）
- 内容说明：包含不同版本的µgreen-db数据库文件，具体字段及数据结构需解压后查看原始文件内容
数据来源
NCBI、SILVA、Comparative RNA Web（CRW）数据库
适用场景
- 微生物生态学研究：用于光合微真核生物与蓝细菌群落的分子分类鉴定
- 宏条形码数据分析：辅助土壤等环境样本23S rRNA基因V结构域序列的属水平分类分配
- 微生物多样性研究：支持基于23S rRNA基因的光合微生物群落组成与结构分析
- 分子生物学工具开发：为光合微生物分类学相关的分子标记工具提供参考数据库支持
