数据集概述
本数据集是论文《Acute stress triggers RNA splicing and protein secretion in humans》的补充表格集合,包含29个文件,涵盖蹦极跳参与者(应激组)与对照组的人口统计学信息、PBMC(外周血单个核细胞)的蛋白质组、磷酸化蛋白质组、转录组数据及分析结果,血浆蛋白质组数据,以及基因本体(GO)富集分析结果等,为研究急性应激的分子机制提供结构化数据支持。
文件详解
- 人口统计学与基础分析类
- 文件名称:Supplementary Table 1(示例:S1_Demographic information of bungee jump participants and control group .xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含蹦极跳参与者(应激组)与对照组的人口统计学信息
- PBMC蛋白质组与磷酸化蛋白质组分析类
- 文件名称:Supplementary Tables 2-9、23-29(示例:S2-T- test results from proteomic measurements of PBMCs within the controls.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖PBMC蛋白质组、磷酸化蛋白质组的T检验、重复测量方差分析(rmANOVA)结果,基因本体(GO)富集分析结果,以及血浆蛋白质组的相关分析数据
- 转录组原始与标准化数据类
- 文件名称:Supplementary Tables 10-11、15-16(示例:S10-Raw count matrix of RNAseq data of PBMCs of jumpers and controls post-filtering.txt)
- 文件格式:TXT、XLSX
- 字段映射介绍:包含RNAseq原始计数矩阵、DESeq2标准化计数矩阵、体外激素刺激后的转录组数据等
- 转录组差异分析与剪接分析类
- 文件名称:Supplementary Tables 12-14、17-22(示例:S12-Wald Test results from RNAseq measurements of PBMCs of jumpers and controls.xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖转录组Wald检验、LimitedRatio检验结果,差异表达基因(DEGs)列表,可变剪接基因分析结果及GO富集分析结果
数据来源
论文“Acute stress triggers RNA splicing and protein secretion in humans”
适用场景
- 应激生物学分子机制研究: 分析急性应激(蹦极跳)对人类RNA剪接、蛋白质分泌及基因表达的影响
- 免疫细胞分子响应分析: 研究PBMC在急性应激下的蛋白质组、磷酸化蛋白质组及转录组变化
- 基因表达与剪接调控研究: 探索急性应激中差异表达基因、可变剪接基因的功能及调控机制
- 血浆蛋白质组与应激关联分析: 分析血浆蛋白质组与PBMC分子变化的相关性,揭示应激系统响应规律
- 生物信息学方法验证: 用于验证转录组、蛋白质组差异分析及GO富集分析等生物信息学方法的应用效果