数据集概述
本数据集围绕铁线蕨属(Adiantum)与带状蕨类(vittarioids)的系统发育关系展开,包含支持铁线蕨属单系性及其与带状蕨类姐妹群关系的分子数据。数据涵盖质体基因序列比对、最大似然分析及贝叶斯分析相关文件,用于验证该类群的进化关系,共包含六个文件。
文件详解
- 说明文档类(.txt格式,共3个)
- 文件名称:README_for_Bayesian_analysis.txt、README_for_Alignments.txt、README_for_ML_analysis.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别对应贝叶斯分析、序列比对、最大似然分析的说明文档,解释各文件的内容逻辑与使用方法
- 序列比对压缩包(.zip格式)
- 文件名称:Alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含6个质体基因的序列比对文件(.nexus格式),涉及atpA(1500bp)、atpB(1257bp)、chlN(621bp)、rbcL(1308bp)、rpoA(613bp)、rps4(612bp)
- 最大似然分析压缩包(.zip格式)
- 文件名称:ML_analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含6个质体基因联合数据集的最大似然分析文件(6_loci_garli.nexus)
- 贝叶斯分析压缩包(.zip格式)
- 文件名称:Bayesian_analysis.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:用于贝叶斯分析的相关数据文件(具体内容未详细说明)
数据来源
论文“Data from: Maidenhair ferns, Adiantum, are indeed monophyletic and sister to shoestring ferns, vittarioids (Pteridaceae)”
适用场景
- 蕨类植物系统发育研究: 验证铁线蕨属的单系性及其与带状蕨类的姐妹群关系
- 质体基因序列分析: 利用atpA、atpB等6个质体基因序列比对数据开展分子进化研究
- 系统发育分析方法应用: 支持最大似然与贝叶斯分析等不同系统发育推断方法的实践
- 植物形态与生态进化关联研究: 结合系统发育框架分析铁线蕨属与带状蕨类的形态、生态差异及进化过程