数据集概述
本数据集包含2019年阿尔卑斯地区37个湖泊和22条河流的浮游生物及生物膜样本高通量测序数据，涵盖蓝细菌16S rRNA和真核微藻18S rRNA的FASTA序列及blastn比对结果，用于分析参考数据库的分类覆盖度。
文件详解
- 描述文档：
- Dataset_Description_EAW.pdf：PDF格式，数据集说明文档
- 序列文件（.fasta格式）：
- fastacyano_eawf2_PL.fasta：蓝细菌浮游生物样本16S rRNA序列
- fastacyano_eawf2_BFM.fasta：蓝细菌生物膜样本16S rRNA序列
- fastaprot_Microalgae_PL_eawf2.fasta：真核微藻浮游生物样本18S rRNA序列
- fastaprot_Microalgae_BFM_eawf2.fasta：真核微藻生物膜样本18S rRNA序列
- 比对结果文件（.tsv格式）：
- EAW_Cyano_blastn_query_genbank_Plankton.tsv：蓝细菌浮游样本blastn结果，字段含query序列、比对ID、分类信息、相似度等
- EAW_Cyano_blastn_query_genbank_Biofilm.tsv：蓝细菌生物膜样本blastn结果
- EAW_EukAlgae_blastn_query_genbank_Plankton.tsv：真核微藻浮游样本blastn结果
- EAW_EukAlgae_blastn_query_genbank_Biofilm.tsv：真核微藻生物膜样本blastn结果
数据来源
Interreg Alpine Space项目Eco-AlpsWater（ASP569）
适用场景
- 水生微生物参考数据库分类覆盖度评估
- 阿尔卑斯地区淡水生态系统微生物多样性研究
- 蓝细菌与真核微藻分子鉴定方法优化
- 环境DNA技术在淡水监测中的应用分析
