数据集概述
本数据集是“利用DNA条形码研究爱尔兰海鳐鱼多样性”四年级研究项目的补充材料,包含鳐鱼COI基因序列、DNA凝胶电泳图像、DNA浓度数据及构建最大似然树的GenBank序列编号,为鳐鱼多样性研究提供分子生物学数据支持。
文件详解
- 序列文件:
- AOC_skate_thesis_2020_consensus_sequences.FASTA:FASTA格式,包含项目生成的鳐鱼COI基因共识序列
- AOC_skate_thesis_2020_collected_GenBank_sequences_for_ML.FASTA:FASTA格式,用于构建最大似然树的GenBank来源序列
- 图像文件:
- 11个.png格式凝胶电泳图像文件(如AOC_skate_thesis_2020_gel_image_B1_to_B4.png):展示不同批次鳐鱼样本的DNA电泳结果
- 表格文件:
- AOC_skate_thesis_2020_DNA_concentrations_Blonde_ray.csv:CSV格式,包含 Blonde ray样本的DNA浓度(ng/ml)和A260/A280比值数据
- AOC_skate_thesis_2020_DNA_concentrations_Thornback_ray.csv:CSV格式,包含 Thornback ray样本的DNA浓度数据
- GenBank_accession_numbers.csv:CSV格式,包含鳐鱼物种的GenBank登录号、学名、俗名及采样地点
- 说明文件:
- READ_ME.txt:TXT格式,包含项目标题、作者等基础信息
适用场景
- 海洋生物学研究:分析爱尔兰海鳐鱼物种多样性及种群遗传结构
- 分子分类学研究:基于COI基因序列开展鳐鱼物种鉴定与系统发育分析
- 保护生物学应用:评估特定鳐鱼物种(如Thornback ray)的遗传多样性现状
- 实验方法验证:验证DNA条形码技术在软骨鱼类多样性研究中的适用性