爱尔兰海鳐鱼多样性DNA条形码研究项目数据集

数据集概述

本数据集是“利用DNA条形码研究爱尔兰海鳐鱼多样性”四年级研究项目的补充材料,包含鳐鱼COI基因序列、DNA凝胶电泳图像、DNA浓度数据及构建最大似然树的GenBank序列编号,为鳐鱼多样性研究提供分子生物学数据支持。

文件详解

  • 序列文件:
  • AOC_skate_thesis_2020_consensus_sequences.FASTA:FASTA格式,包含项目生成的鳐鱼COI基因共识序列
  • AOC_skate_thesis_2020_collected_GenBank_sequences_for_ML.FASTA:FASTA格式,用于构建最大似然树的GenBank来源序列
  • 图像文件:
  • 11个.png格式凝胶电泳图像文件(如AOC_skate_thesis_2020_gel_image_B1_to_B4.png):展示不同批次鳐鱼样本的DNA电泳结果
  • 表格文件:
  • AOC_skate_thesis_2020_DNA_concentrations_Blonde_ray.csv:CSV格式,包含 Blonde ray样本的DNA浓度(ng/ml)和A260/A280比值数据
  • AOC_skate_thesis_2020_DNA_concentrations_Thornback_ray.csv:CSV格式,包含 Thornback ray样本的DNA浓度数据
  • GenBank_accession_numbers.csv:CSV格式,包含鳐鱼物种的GenBank登录号、学名、俗名及采样地点
  • 说明文件:
  • READ_ME.txt:TXT格式,包含项目标题、作者等基础信息

适用场景

  • 海洋生物学研究:分析爱尔兰海鳐鱼物种多样性及种群遗传结构
  • 分子分类学研究:基于COI基因序列开展鳐鱼物种鉴定与系统发育分析
  • 保护生物学应用:评估特定鳐鱼物种(如Thornback ray)的遗传多样性现状
  • 实验方法验证:验证DNA条形码技术在软骨鱼类多样性研究中的适用性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.7 MiB
最后更新 2025年12月20日
创建于 2025年12月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。