数据集概述
本数据集包含跳甲（Alticini）宿主植物关联与多样化研究的相关数据，涉及101属608种跳甲的系统发育关系重建，以及分支特异性多样化速率分析。数据通过线粒体基因组和细胞色素氧化酶I基因进行分析，探讨宿主植物关联对跳甲多样化的影响，为研究跳甲快速辐射进化的驱动因素提供基础。
文件详解
- 系统发育树文件
- 文件名称：Alticini_COI.608.RLC.pb.nwk、Mito_113.phylobayes.nc.15.tre、Mito_113.treesearch.nc.15.05.tre、Mito_113.treesearch.aa.15.08.tre、Mito_113.phylobayes.aa.15.tre、Alticini_COI.612.RLC.pb.tre
- 文件格式：.nwk、.tre
- 字段映射介绍：包含基于线粒体基因组（Mito）和细胞色素氧化酶I（COI）基因重建的跳甲系统发育树，记录不同分析方法（如phylobayes、treesearch）得到的系统发育关系。
- 序列文件
- 文件名称：Alticini_Mito.113.nc.fas、Alticini_COI.612.fas、Alticini_Mito.113.aa.fas
- 文件格式：.fas
- 字段映射介绍：包含跳甲线粒体基因组和COI基因的核苷酸（nc）及氨基酸（aa）序列数据。
- 模型文件
- 文件名称：Mito_113.modeltest.aa.15.best_model.nex、Mito_113.modeltest.nc.15.best_model.nex、Alticini_COI.612.008.r018.best_model.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：记录模型测试得到的最佳进化模型，用于系统发育分析。
- 压缩文件
- 文件名称：Alticini_Mito.113.single_genes.nc.zip、Alticini_Mito.113.single_genes.aa.zip
- 文件格式：.zip
- 字段映射介绍：包含跳甲线粒体基因组单个基因的核苷酸和氨基酸序列压缩包。
- 其他文件
- 文件名称：README.md、Alticini_COI.612.nex、Alticini_COI.612.RLC.pb.xml、Alticini_COI.612.008.r018.treefile
- 文件格式：.md、.nex、.xml、.treefile
- 字段映射介绍：包含研究说明文档、序列比对文件、分析参数文件及系统发育树文件。
适用场景
- 跳甲系统发育研究：用于分析跳甲属种间的系统发育关系，探讨其进化历史。
- 多样化速率分析：研究跳甲分支特异性多样化速率，分析宿主植物关联对多样化的影响。
- 进化模型选择：为相关研究提供跳甲基因序列的最佳进化模型参考。
- 生物多样性研究：支持跳甲宿主植物关联与生物多样性关系的深入分析。
