找到15个数据集

标签: treefile

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  • Alticini_Host_Jumping_跳甲宿主关联与多样化研究数据

    2026年1月22日 30 71 29

    数据集概述 本数据集包含跳甲(Alticini)宿主植物关联与多样化研究的相关数据,涉及101属608种跳甲的系统发育关系重建,以及分支特异性多样化速率分析。数据通过线粒体基因组和细胞色素氧化酶I基因进行分析,探讨宿主植物关联对跳甲多样化的影响,为研究跳甲快速辐射进化的驱动因素提供基础。 文件详解 系统发育树文件...
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  • C_bovis_Genome_Source_牛隐杆线虫基因组与进化分析数据

    2026年1月21日 30 79 20

    数据集概述 本数据集为论文“The genome of C. bovis”的核心数据文件,包含牛隐杆线虫(C....
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  • Sirex_noctilio_Based_膜翅目昆虫紫外_绿光二色视觉研究数据

    2026年1月19日 30 105 58

    数据集概述 本数据集围绕膜翅目昆虫Sirex noctilio的视觉生理特征展开,包含其视觉视蛋白基因的基因组比较、系统发育分析数据及视网膜电图实验数据,证实该物种为紫外-绿光二色视觉生物,用于研究膜翅目昆虫感光受体多样性的演化机制。 文件详解 script_ERG_complete.R 文件格式:R...
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  • 水蚤精子进化研究相关脚本数据集

    2025年12月20日 30 203 9

    数据集概述 该数据集包含Duneau等人关于水蚤(Daphnia)精子进化研究的相关脚本与辅助文件,涵盖数据分析代码、序列比对文件、系统发育树文件、实验结果表格及方法说明文档,为复现该研究提供完整的技术支持。 文件详解 代码文件: Daphnia_sperm_anc_state.R: R语言脚本文件,可能用于祖先状态重建分析 序列数据文件:...
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  • 马达加斯加西北部侏儒壁虎分子系统学与新物种描述数据集

    2025年12月18日 30 109 82

    数据集概述 本数据集为论文《马达加斯加西北部神秘侏儒壁虎Lygodactylus ornatus的分子系统学及L. verticillatus群新物种描述》的配套数据,包含原始DNA比对及系统发育树文件,支持对该区域侏儒壁虎物种分类与进化关系的研究。 文件详解...
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  • 质体外膜蛋白进化历史研究的比对与树文件数据集

    2025年12月5日 30 77 40

    数据集概述 该数据集包含为研究“质体外膜蛋白的进化历史——结构-序列比较”而生成的比对文件与系统发育树文件,涉及OEP40、OEP21A_B等多个质体外膜蛋白家族,支持结构与序列层面的进化分析。 文件详解 系统发育树文件(.treefile格式,共5个): OEP40_ginsi.fas.treefile:OEP40蛋白序列的系统发育树文件...
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  • 软骨鱼类特异性T2R亚型与脊椎动物苦味受体起源研究数据集

    2025年12月15日 30 166 93

    数据集概述 本数据集为研究论文《软骨鱼类特异性T2R亚型与脊椎动物苦味受体起源》的配套支持信息,包含系统发育树文件、实验结果图片及序列与表格文档,为探究软骨鱼类T2R受体进化及脊椎动物苦味受体起源提供数据支撑。 文件详解 系统发育树文件(.treefile格式):...
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  • CPR细菌动物关联进化路径研究数据集

    2025年12月15日 30 107 106

    数据集概述 该数据集包含与Jaffe et al. 2021研究相关的候选门辐射(CPR)基因组子集数据及补充材料,涉及基因含量、共现模式与细菌动物关联进化路径的研究内容。 文件详解 jaffe_et_al_2021_file1_rp16tree.treefile:treefile格式文件,可能包含基于rp16基因构建的系统发育树数据...
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  • 新热带蜘蛛属Ciniflella补充数据集

    2025年12月8日 30 43 16

    数据集概述 本数据集是关于新热带蜘蛛属Ciniflella(Araneae: Zoropsidae, Tengellinae)研究的补充数据,包含系统发育数据集、系统发育树及补充图表,为该属蜘蛛的分类学与系统发育研究提供数据支持。 文件详解 序列文件(.fas格式,共7个): 12s.fas:12S DNA标记的序列比对文件 16s.fas:16S...
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  • 木槿族_锦葵科_系统发育关系研究比对与树文件数据集

    2025年12月8日 30 108 58

    数据集概述 本数据集包含木槿族(锦葵科)系统发育关系研究的基因比对文件与系统发育树文件,基于迄今最全面的分类群采样构建,涉及传统定义的木槿属和孔雀葵属的多系性分析,以及新属的分类修订,为该族植物分类提供关键数据支持。 文件详解 数据集包含5个文件,具体说明如下: - 文件名称:README.md - 文件格式:Markdown(.md) -...
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  • 巴西受威胁十足目物种多样性模式研究数据与R代码

    2025年11月30日 30 100 90

    数据集概述 本数据集为《巴西受威胁十足目物种多样性模式》论文配套的数据与R代码,包含2016年和2022年两个评估期的十足目物种分布坐标、系统发育树文件及多样性分析脚本,基于IUCN标准对比物种丰富度、系统发育多样性与系统发育特有性的空间模式,支持相关研究的复现与扩展。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下: - Diversity...
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  • MDHAR基因家族完整系统发育树数据集

    2025年11月29日 30 47 29

    数据集概述 该数据集包含通过最大似然法构建的不同物种MDHAR基因家族的完整系统发育树,聚焦生物基因领域的系统发育关系研究。 文件详解 文件名称:MDHAR phylogenetic tree.treefile 文件格式:.treefile 内容说明:采用最大似然法构建的不同物种MDHAR基因家族系统发育树文件 适用场景...
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  • dsrAB参考树与环境序列分类归属数据集

    2025年11月29日 30 177 48

    数据集概述 本数据集包含用于环境序列分类归属的dsrAB蛋白参考数据库、系统发育树及相关分析文件,基于Müller等(2015)的数据集更新,涵盖经人工校对的1313条dsrAB蛋白序列分类信息,支持环境序列的系统发育分析与分类归属研究。 文件详解 文件名称: mothur.batch:格式为.batch,是Mothur...
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  • 功能古菌鞭毛机制的水平基因转移数据集

    2025年11月29日 30 178 8

    数据集概述 本数据集围绕古菌鞭毛机制向细菌的水平基因转移展开,包含相关基因序列、系统发育树及补充信息,支持研究古菌鞭毛基因在绿弯菌门细菌中的分布、结构及进化来源,为跨原核生物域的基因转移研究提供数据基础。 文件详解 说明文档: ReadMe.txt: 文本格式说明文档,概述数据内容,包括通用标记基因串联序列、绿弯菌门参考系统发育树文件等信息。...
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  • 针毛虫类系统基因组学分析数据集

    2025年11月28日 30 169 52

    数据集概述 本数据集用于解析环节动物门游走亚门针毛虫类(Aciculata)的系统发育关系,包含转录组矩阵、物种树(ASTRAL和串联超矩阵方法构建)及用于数据探索的基因树,支持相关类群进化关系的研究。 文件详解 根目录文件: 80pAciculata.supermatrix.fa:FA格式文件,可能为80%物种覆盖度的超矩阵序列文件...
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