dsrAB参考树与环境序列分类归属数据集

数据集概述

本数据集包含用于环境序列分类归属的dsrAB蛋白参考数据库、系统发育树及相关分析文件,基于Müller等(2015)的数据集更新,涵盖经人工校对的1313条dsrAB蛋白序列分类信息,支持环境序列的系统发育分析与分类归属研究。

文件详解

  • 文件名称: mothur.batch:格式为.batch,是Mothur v.1.44.1软件的批处理命令文件,用于处理环境序列。
  • 文件名称: PROTEIN_REF_AND_OTU_ALIGNED ordered.fas:格式为.fas,是参考dsrAB蛋白序列与聚类后序列代表的蛋白比对文件,使用MAFFT软件生成。
  • 文件名称: Reference tree with taxonomy coloured.treefile:格式为.treefile,是基于参考数据库构建的系统发育树文件,用于环境序列的分类归属推断。
  • 文件名称: REFERENCES PROTEIN ALIGNMENT.aln:格式为.aln,是更新后的dsrAB蛋白参考序列比对文件,包含1313条人工校对分类信息的记录。

适用场景

  • 微生物分类学研究:用于环境样本中含dsrAB基因微生物的分类归属分析
  • 系统发育分析:基于参考树推断环境序列的系统发育关系
  • 环境微生物群落研究:结合NGS数据解析环境中特定功能微生物的多样性
  • 生物信息学方法验证:测试蛋白序列比对、系统发育树构建等分析流程的有效性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.54 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。