数据集概述
本数据集为捕食性带状蠕虫Amphiporus lactifloreus的蛋白转录组分析结果，包含其潜在新型分泌毒素的相关数据。研究聚焦该蠕虫吻部表达的毒素样转录本及黏液蛋白质组中的分泌毒素成分，识别出金属蛋白酶、类海葵毒素等候选毒素，命名了两种新毒素U-nemertotoxin-1和U-nemertotoxin-2，共23个相关文件。
文件详解
- 转录组组装文件
- 文件名称：AdditionalFile07_Assembly_Trinity_Amphiporus.fasta、AdditionalFile08_Assembly_Trinity_Notospermus.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含Amphiporus lactifloreus和参考物种Notospermus的转录组组装序列
- 蛋白序列文件
- 文件名称：AdditionalFile09_Transdecoder_Amphiporus.pep、AdditionalFile10_Transdecoder_Notospermus.pep
- 文件格式：PEP
- 字段映射介绍：通过TransDecoder预测的Amphiporus lactifloreus和Notospermus的蛋白序列
- 蛋白质组结果文件
- 文件名称：AdditionalFile04_ProteomeResults_Epidermis.xlsx、AdditionalFile05_ProteomeResults_Mucus.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：表皮和黏液样本的蛋白质组分析结果
- BLASTP结果文件
- 文件名称：AdditionalFile16_BLASTP_Results_SwissProt_Amphiporus_1e3.tsv、AdditionalFile18_BLASTP_Results_ToxProt_Amphiporus_1e3.tsv等
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含转录本/蛋白序列与SwissProt、ToxProt等数据库的比对结果，字段包括序列ID、数据库匹配条目、相似度、E值等
- 数据库文件
- 文件名称：AdditionalFile11_BLASTP_Database_Swissprot.fasta、AdditionalFile13_BLASTP_Database_APD_AMPs_fasta_DongChuan_03_2020.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：BLASTP分析所用的参考数据库序列
- 比对结果压缩文件
- 文件名称：AdditionalFile22_Alignments_ProteomeMucus.zip、AdditionalFile23_Alignments_TranscriptomeProboscis.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：黏液蛋白质组和吻部转录组的比对结果压缩包
数据来源
论文“Proteo-transcriptomic analysis identifies potential novel toxins secreted by the predatory, prey-piercing ribbon worm Amphiporus lactifloreus”
适用场景
- 海洋无脊椎动物毒素组学研究: 分析带状蠕虫Amphiporus lactifloreus的毒素分泌系统及新型毒素成分
- 生物进化研究: 探究带状蠕虫吻部从腐生器官向毒素分泌捕食器官的进化过程
- 生物毒素应用开发: 挖掘潜在新型生物毒素资源，为医药、农业等领域提供候选分子
- 比较转录组学分析: 对比Amphiporus lactifloreus与参考物种Notospermus的毒素相关基因表达差异
- 蛋白质组学验证: 结合转录组与蛋白质组数据，验证黏液中分泌毒素的真实存在及功能
