数据集概述
本数据集为鲤形目（包括鲤科、鳅科等约4300种淡水鱼类）的系统发育基因组学研究数据，基于锚定富集方法构建，包含172个鲤形目类群及3个外群的219个基因座（总长315,288 bp），旨在解决该类群系统发育关系的争议，为进化生物学研究提供框架。
文件详解
- 文件名称：
LociPartitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录基因座分区信息，包含各DNA分区的编号及对应的碱基位置范围（如L1=1-1650、L2=1651-3305等）
- 文件名称：
Alignment.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：包含172个鲤形目类群及外群的序列比对数据，为系统发育分析的核心输入文件
- 文件名称：
CypriniformesFullTree.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：存储基于连接分析构建的鲤形目系统发育树，节点支持率达97%为100% bootstrap支持
- 文件名称：
ProbeDesignFiles.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含锚定富集实验所用的探针设计相关文件，支持实验方法的复现
数据来源
论文“Resolving Cypriniformes relationships using an anchored enrichment approach”
适用场景
- 鲤形目系统发育研究：分析类群间的亲缘关系，验证或修正传统分类系统
- 进化生物学研究：探讨鲤形目物种的分化时间、适应辐射及特征演化规律
- 比较基因组学分析：基于基因座数据开展基因家族扩张/收缩、选择压力等研究
- 分子系统学方法验证：评估锚定富集技术在淡水鱼类系统发育分析中的应用效果
