数据集概述
本数据集包含古代巨型短面熊（Tremarctinae亚科）的线粒体DNA研究数据，涉及南北美洲巨型短面熊（Arctodus simus与Arctotherium angustidens）及现生眼镜熊的演化关系分析，揭示其趋同演化特征。数据集含4个文件，支持分子系统发育分析。
文件详解
- PartitionFinder_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含PartitionFinder分析相关文件，用于序列数据的分区策略优化
- BEAST_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含BEAST分析相关文件，用于分子系统发育与演化时间估算
- Arctotherium_SeqData_Filtered_Collapsed.fastq.gz
- 文件格式：GZ压缩FASTQ
- 内容说明：过滤并合并后的Arctotherium样本线粒体DNA序列数据
- RAxML_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含RAxML分析相关文件，用于构建最大似然系统发育树
数据来源
论文“Ancient mitochondrial DNA reveals convergent evolution of giant short-faced bears (Tremarctinae) in North and South America”
适用场景
- 古生物线粒体DNA演化分析: 研究巨型短面熊亚科的系统发育关系与演化历史
- 趋同演化机制研究: 分析南北美洲巨型短面熊体型趋同演化的分子基础与适应意义
- 物种灭绝时间推断: 结合线粒体DNA数据探讨巨型短面熊的灭绝时间与环境关联
- 古生物分子数据处理方法验证: 测试PartitionFinder、BEAST等工具在古代DNA数据分析中的应用效果
