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Xiphophorus_Dryad_Based鱼类系统基因组学演化分析数据
2026年1月21日 30 162 123
数据集概述 本数据集包含剑尾鱼和新月鱼属(Xiphophorus)鱼类的系统基因组学研究数据,用于解析该属26个物种的进化关系,重点解决杂交导致的系统发育冲突问题。数据支持重建考虑不完全谱系分选和杂交的高置信度物种树,重新探讨性选择特征“剑尾”的演化争议,揭示该属广泛的网状演化历史。 文件详解 文件名称:Dryad.zip 文件格式:ZIP...
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Cardioglossa_Based非洲长指蛙属系统发育与物种分化研究数据
2026年1月21日 30 141 74
数据集概述 本数据集包含非洲长指蛙属(Cardioglossa)18个物种的系统发育分析相关文件,基于线粒体和核基因位点数据构建。涵盖系统发育树、分区方案、物种界定分析等结果,支持研究该属物种的分化时间、生物地理历史及体色分化机制,共8个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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Hyla_andersonii_Based_松树林蛙地理变异多维度研究数据
2026年1月21日 30 120 24
数据集概述 本数据集围绕美国东部松树林蛙(Hyla andersonii)的三个离散种群,整合遗传、形态测量和声学信号三类多变量数据,用于评估种群间的基因、行为及形态交换性,为物种界定及保护单元划分提供依据,共包含9个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README_for_R_script_Acoustic_calc_CC0.docx...
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Gesneriaceae_Based_核基因靶向捕获_系统基因组学研究数据
2026年1月21日 30 147 20
数据集概述 本数据集为苦苣苔科(Gesneriaceae)核基因靶向捕获的系统基因组学研究数据,包含针对该科设计的830个单拷贝基因捕获探针、参考序列、系统发育树及补充表格等7个文件,用于解析苦苣苔科的系统发育关系,支持不同分类水平的进化研究。 文件详解 描述文件 文件名称:DESCRIPTION.txt 文件格式:TXT...
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PartitionFinder_Data_系统发育分析_分子进化模型选择数据
2026年1月20日 30 156 14
数据集概述 本数据集包含用于系统发育分析的相关数据,涉及分子序列数据的分区方案和替代模型的选择。数据支持对分区方案的客观选择,以提升系统发育重建的准确性,适用于大型多位点DNA数据集的分析。数据集共包含四个文件,分为压缩文件和文档文件两类。 文件详解 文档文件 文件名称:README_for_Table_1_and_2_datasets.txt...
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Megalobrachium_Based_中美地峡隆起与海洋物种形成研究数据
2026年1月20日 30 126 69
数据集概述 本数据集围绕中美地峡隆起过程中海洋新热带浅水物种的演化展开,聚焦异尾蟹属Megalobrachium的物种形成机制。通过分析该属13个已知物种及3个潜在新物种的线粒体与核基因序列,构建时间校准的系统发育树,结合祖先区域重建探讨其历史生物地理过程,揭示中美地峡形成对物种分化的影响。 文件详解...
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Molecular_Pleuronectiformes_单系性分子证据研究数据
2026年1月20日 30 54 1
数据集概述 本数据集为支持鲽形目(Pleuronectiformes)单系性的分子证据研究数据,包含基因树、补充表格及组合数据集等文件。针对该类群进化关系的争议,通过重新分析现有数据并结合新数据,明确支持其单系性,反驳了不对称体型独立起源的观点,为解决系统发育难题提供数据支撑。 文件详解 文件名称:GENE_TREES_STAR_SP_TREE.tre...
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Platania_Cardoso_Based_新喀里多尼亚叶甲生物地理分析数据
2026年1月19日 30 112 37
数据集概述 本数据集为Platania, Cardoso et al.关于新喀里多尼亚叶甲生物地理研究的配套数据,包含系统发育树、模型参数文件、序列比对分区信息、多基因序列数据及生物地理分析输入文件压缩包,共5个文件,支撑南太平洋特有叶甲谱系的历史生物地理研究。 文件详解 系统发育树文件...
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Epinecrophylla_Based_新热带区枯叶觅食蚁鹩系统发育研究数据
2026年1月19日 30 142 128
数据集概述 本数据集为新热带区枯叶觅食蚁鹩(Epinecrophylla属)的系统发育研究数据,基于超保守元件(UCEs)大规模平行测序,包含该属8个物种的亚种级系统发育树、种群遗传分析及修订分类相关的原始与处理数据,共8个文件,支持鸟类分类学与生物地理学研究。 文件详解 核心分析文件 文件名称:UCE_gene_trees-RAxML.tre...
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Dryad_Leptonetid蜘蛛系统基因组学与生物地理学研究数据集2021
2026年1月19日 30 134 80
数据集概述 本数据集为Leptonetid科蜘蛛的系统基因组学与生物地理学研究数据,包含基于超保守元件(UCEs)构建的“宽松”和“严格”两种数据矩阵,以及系统发育分析、分子定年、生物地理推断等相关结果文件,共11个文件,支持该科蜘蛛的分类修订、演化历史及分布格局研究。 文件详解 文档类文件 文件名称:READMELedfordetal2021.txt...
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Galápagos_Serpentes_Dipsadidae_蛇类辐射演化研究数据
2026年1月18日 30 200 195
数据集概述 本数据集围绕加拉帕戈斯蛇类辐射演化研究展开,包含系统发育分析相关的序列比对、字符集定义及时间校准树文件,支持揭示该类群的起源与隐藏多样性,涉及Pseudalsophis属等物种的分类与演化研究,共7个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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Metatranscriptomics_Based_鸟类血液寄生虫宏转录组研究数据
2026年1月18日 30 107 89
数据集概述 本数据集基于北美鸣禽24份血液样本的宏转录组测序,针对低强度、多物种感染的血液寄生虫(血孢子虫)开展研究。通过分离宿主与寄生虫转录本并分配至血孢子虫属,提供33个系统发育多样化的血孢子虫线粒体谱系的1,502个单拷贝直系同源基因座数据,可支持寄生虫进化与感染检测研究。 文件详解 文档类文件...
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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据
2026年1月18日 30 94 21
数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件(UCE)诱饵集,包含36个半翅目样本(覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属)及1个缨翅目外群的UCE数据,同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果,可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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Metazoa_Phylogenetic_Signal_后生动物系统发育基因组数据集
2026年1月18日 30 169 83
数据集概述 本数据集为后生动物系统发育研究的基因组数据,包含1080个直系同源基因座,源自36个公开基因组,覆盖主要动物类群。数据用于优化系统发育信号分区,支持栉水母作为其余后生动物姊妹群的结论,提供基因组系统发育分析的工作流与工具,共15个文件。 文件详解 RAxML_single_genes.zip 文件格式:ZIP...
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Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据
2026年1月18日 30 192 136
数据集概述 本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果,包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本,可支持物种系统发育与种群遗传学研究,共6个文件。 文件详解 序列比对文件 文件名称:Alignment_for_RAxML.phy 文件格式:PHY...
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Hawkmoth_Dryad_Based_反蝙蝠超声产生与声纳干扰行为及系统发育数据
2026年1月18日 30 67 30
数据集概述 本数据集聚焦天蛾与蝙蝠的协同进化关系,包含124种天蛾对蝙蝠声纳攻击的超声响应行为数据、蝙蝠-天蛾捕食实验结果,以及基于多基因构建的化石校准系统发育树。数据覆盖天蛾超声产生的功能验证(声纳干扰)和进化历史分析,涉及约1500种天蛾的防御策略起源与分化时间研究。 文件详解 系统发育树文件...
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Tamalia_inquilinus_Based社会性寄生蚜虫起源与遗传分化研究数据
2026年1月18日 30 13 9
数据集概述 本数据集包含社会性寄生蚜虫Tamalia inquilinus起源与遗传分化研究的相关文件,涉及基因序列、系统发育树、表达分析结果等内容,支持对该蚜虫与宿主的进化关系、种群结构及宿主植物关联分化的研究,共10个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共4个)...
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TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据
2026年1月12日 30 94 81
数据集概述 本数据集为热带东太平洋(TEP)Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据,整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息,用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限,结果支持二者为同一物种。 文件详解 文件名称:Nobia-maf02_SNPS.vcf,格式:VCF...
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Becchimanzi_2025_榛子内生镰刀菌分离株基因组测序及系统发育代谢组学分析数据
2026年1月17日 30 51 29
数据集概述 本数据集包含Becchimanzi等人2025年手稿相关的原始数据和输出文件,核心内容为榛子内生镰刀菌分离株(Fusarium sp. Hzn5)的基因组测序数据,以及antiSMASH分析结果和系统发育重建文件,用于支持系统发育与代谢组学研究。 文件详解...
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Japanese_macaque_Phylogeographic_history_data
2026年1月17日 30 164 131
数据集概述 本数据集为日本猕猴系统地理学研究数据,包含11个文件,涵盖遗传分析代码、序列数据、种群结构分析结果等。主要用于探究日本猕猴的地理遗传变异模式及进化过程,支持种群结构、基因流、末次盛冰期避难所分布等研究,为理解其系统发育历史提供数据支撑。 文件详解 代码文件 文件名称:calc_pi.R 文件格式:R...



