数据集概述
本数据集包含已灭绝南美巨型雕齿兽（Doedicurus sp.）的古DNA研究相关数据，涉及雕齿兽及现存犰狳的测序数据、系统发育分析文件、NGS流程脚本等，用于揭示雕齿兽的进化起源与系统发育关系，支持古生物进化研究。
文件详解
- 测序数据文件
- 文件名称：Doedicurus_sp._SeqData_Filtered_Collapsed.fastq.gz、Chaetophractus_villosus_SeqData_Filtered_Collapsed.fastq.gz、Tolypeutes_matacus_SeqData_Filtered_Collapsed.fastq.gz、Zaedyus_pichiy_SeqData_Filtered_Collapsed.fastq.gz
- 文件格式：fastq.gz（压缩测序文件）
- 字段映射介绍：包含雕齿兽及现存犰狳物种的过滤后、合并的高通量测序数据
- 系统发育分析文件包
- 文件名称：PAUP_files.zip、RAxML_files.zip、PartitionFinder_files.zip、MrBayes_files.zip、BEAST_files.zip
- 文件格式：zip（压缩包）
- 字段映射介绍：包含用于PAUP、RAxML、PartitionFinder、MrBayes、BEAST等系统发育分析工具的输入文件与结果文件
- 流程脚本文件包
- 文件名称：NGS_pipeline_scripts.zip
- 文件格式：zip（压缩包）
- 字段映射介绍：包含高通量测序数据处理的流程脚本文件
数据来源
论文“Ancient DNA from the extinct South American giant glyptodont Doedicurus sp. (Xenarthra: Glyptodontidae) reveals that glyptodonts evolved from Eocene armadillos”
适用场景
- 古生物进化关系研究: 利用测序数据与系统发育分析文件，探究雕齿兽与现存犰狳的进化亲缘关系
- 分子系统发育分析: 通过PAUP、RAxML等工具文件，开展雕齿兽的系统发育树构建与验证
- 古DNA数据处理方法研究: 参考NGS流程脚本，优化灭绝物种古DNA的测序数据处理流程
- 南美古生物演化环境关联分析: 结合雕齿兽进化时间线数据，研究南美古环境变化对物种演化的影响
