数据集概述
本数据集为南极冰鱼姐妹谱系识别研究相关数据,包含用于系统发育分析的DNA序列比对、系统发育树、BEAST输入文件及说明文档,旨在通过系统发育分析明确南极冰鱼的姐妹谱系,重建其生物地理历史,为理解南极适应性辐射的演化起源提供数据支持。
文件详解
- README_for_percophis.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,可能包含数据背景、文件说明、使用方法等信息
- percophis.phy
- 文件格式:PHY
- 字段映射介绍:DNA序列比对文件,用于RAxML系统发育推断,包含南极冰鱼及近缘类群的10个蛋白编码核基因序列数据
- percophis_boottree.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:系统发育树文件,包含带节点支持度的系统发育树结构,展示南极冰鱼与姐妹谱系的亲缘关系
- percothenA.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST输入文件,用于分歧时间分析,整合了系统发育关系、地理分布和古地理历史等信息
数据来源
论文“Identification of the notothenioid sister lineage illuminates the biogeographic history of an Antarctic adaptive radiation”
适用场景
- 极地鱼类系统发育研究: 用于分析南极冰鱼与其他鲈形目鱼类的亲缘关系,明确其姐妹谱系
- 生物地理历史重建: 结合分歧时间和地理分布数据,探究南极冰鱼的起源与演化过程
- 适应性辐射机制分析: 研究南极冰鱼对南极极端环境的适应性演化机制
- 古地理事件与生物演化关联研究: 分析东冈瓦纳大陆破碎化等古地理事件对南极冰鱼分布格局的影响
- 分子系统学方法验证: 用于测试多基因序列数据在解决复杂系统发育关系中的有效性