数据集概述
本数据集围绕按蚊属的系统发育关系与分化时间展开,包含COI、COII和5.8S rRNA基因的综合数据。通过最大似然法和贝叶斯推断,分析了按蚊属七个亚属中的六个,揭示新热带支系(Stethomyia、Kerteszia、Nyssorhynchus)的单系性及其在晚白垩纪的分化时间。数据集包含3个文件,用于支持按蚊属进化研究。
文件详解
- README_for_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据说明文档,包含研究标题、作者信息及文件描述,说明各文件用途(如mrbayes和phyml单分区文件、raxml比对文件等)。
- concat.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:系统发育分析文件,可能包含基因序列比对数据及分区信息,用于最大似然法或贝叶斯推断分析。
- data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,包含mrbayes分区文件、raxml比对文件、分区方案文件等(如mb_part.nex、anopheles.phy、part.txt、best_scheme.txt)。
数据来源
论文“Diversification of the genus Anopheles and a Neotropical clade from the Late Cretaceous”
适用场景
- 按蚊属系统发育研究:用于分析按蚊属亚属间的亲缘关系与分化时间,验证单系性假设。
- 新热带支系进化分析:探究Stethomyia、Kerteszia、Nyssorhynchus亚属的分化历史及地理分布相关性。
- 分子系统学方法验证:比较最大似然法与贝叶斯推断在按蚊属系统发育分析中的应用效果。
- 基因序列数据整合:为蚊科昆虫的分子进化研究提供COI、COII和5.8S rRNA基因的综合数据集。