数据集概述
本数据集记录纽约市都市圈23个白足鼠种群的基因组变异情况，通过ddRAD-Seq技术生成超10000个SNP标记，分析城市化梯度（不透水面覆盖率、人口密度）对种群基因组多样性、分化模式的影响，含基因组数据压缩包及样本文件共4个。
文件详解
- 文件名称：wfm191vcf.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含VCF格式的白足鼠种群基因组变异原始数据，记录SNP位点的基因型信息
- 文件名称：wfm191genepop.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包，推测包含GenePop格式的种群遗传学数据，用于种群分化、基因流等分析
- 文件名称：wfm_bedassle_samples.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含SNP位点编号列表，如snp739、snp942等，共20个SNP位点标识符
- 文件名称：wfm_bedassle_alleles.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：推测包含BEDASSLE分析所需的等位基因频率或基因型数据（无预览内容，基于文件名推断）
数据来源
论文“Population genomics of the Anthropocene: urbanization is negatively associated with genome-wide variation in white-footed mouse populations”
适用场景
- 城市生态学研究：分析城市化梯度对野生动物种群基因组多样性的影响机制
- 种群遗传学分析：利用SNP标记研究白足鼠种群的遗传分化、基因流及进化潜力
- 环境抗性模型构建：基于不透水面数据验证隔离-by-抗性模型对种群遗传结构的解释力
- 基因组多样性保护：评估城市化导致的种群遗传瓶颈效应，为城市生物多样性保护提供依据
- 进化生物学研究：探究人类活动驱动下野生动物种群的快速进化响应
