数据集概述
本数据集包含拟南芥(Arabidopsis thaliana)在SuperFifty(SF)预处理后对百草枯(PQ)诱导的氧化胁迫响应的转录组、代谢组和脂质组分析数据。研究显示SF预处理可预防PQ引起的坏死损伤,通过多组学分析揭示SF调控的基因表达、代谢物积累及脂质变化,为植物抗逆机制研究提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:Arabidobsis Super50 2020 RNAseq.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含转录组分析结果,涉及ROS标记基因、程序性细胞死亡相关基因、自噬相关基因、碳水化合物代谢基因、激素信号基因、抗氧化基因等表达数据;代谢组分析中胁迫保护代谢物(如麦芽糖)、三羧酸循环中间产物(如延胡索酸、苹果酸)的积累数据;脂质组分析中与氧化胁迫相关脂质(如三酰甘油)的变化数据。
适用场景
- 植物抗逆机制研究:分析SF预处理对拟南芥抵抗PQ诱导氧化胁迫的转录组、代谢组和脂质组调控机制。
- 海藻提取物抗逆应用研究:探索海藻提取物Ascophyllum nodosum在植物抗逆中的作用及应用潜力。
- 氧化胁迫响应通路分析:研究ROS相关基因、程序性细胞死亡及自噬通路在胁迫中的变化及SF的调控作用。
- 代谢物与脂质组学研究:分析SF预处理后拟南芥中代谢物(如麦芽糖、三羧酸循环中间产物)和脂质(如三酰甘油)的变化及其与抗逆性的关系。
- 植物抗逆分子育种:为植物抗逆性分子标记筛选及育种提供多组学数据支持。