数据集概述
本数据集围绕北美Arabidopsis lyrata的气候适应性展开研究，通过41个异交种群的全基因组池测序数据，分析两个遗传集群中与气候变量相关的基因位点，探讨开花时间等生物学过程在适应性中的作用，揭示不同谱系气候适应的基因组机制差异。
文件详解
- Walden_Lyrata_Genelength.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含研究中检测到SNP的所有基因信息，为基因长度及相关基础数据记录
- Walden_Lyrata_Topoutliers.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录与气候变量关联的异常位点（outlier SNPs）信息，包含候选适应性基因的筛选结果
- Walden_Lyrata_GWASresults.bed
- 文件格式：BED
- 字段映射介绍：全基因组关联分析（GWAS）结果数据，标注与气候变量相关的基因位点在基因组上的位置信息
- Walden_Lyrata_GOenrichment.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基因本体（GO）富集分析结果，包含与气候适应性相关的生物学过程、分子功能及细胞组分的富集信息
数据来源
论文“Lineage-specific adaptation to climate involves flowering time in North American Arabidopsis lyrata”（作者Walden, Lucek and Willi）
适用场景
- 植物气候适应性基因组研究：分析北美Arabidopsis lyrata不同谱系对气候梯度的适应性遗传机制
- 开花时间调控机制研究：基于候选基因及GO富集结果，探究开花时间相关基因在气候适应中的作用
- 群体遗传学分析：利用全基因组池测序数据，研究种群遗传结构与气候变量的关联
- 进化生物学研究：探讨物种在冰川退缩后扩张过程中，遗传漂变与自然选择对适应性进化的影响
- 功能基因组学研究：通过GO富集分析结果，挖掘与非生物胁迫、昼夜节律等相关的适应性通路
