数据集概述
本数据集围绕Arabidopsis lyrata亚种冰期后生态型形成展开，包含20个种群的全基因组重测序关联分析结果、根系形态数据、群体ID及连锁不平衡估计等信息，聚焦底物适应相关基因及交配系统转变对生态型形成的影响，共5个文件。
文件详解
- Outlier_SNPs.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含与底物适应相关的异常单核苷酸多态性（SNP）数据
- population_IDs.txt
- 文件格式：TXT
- 内容说明：记录20个种群的ID映射关系，如IA2对应11X、MD2对应11P等
- Root_morphology_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容说明：包含不同底物来源植株在共同环境下的根系生长数据，如根生长速度、侧根数量等
- Genotypes_VCFs.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含种群基因型数据的VCF格式文件
- LD_estimates_per_population_using_ldx.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含各种群基于ldx方法的连锁不平衡估计数据
数据来源
论文“Postglacial ecotype formation under outcrossing and self-fertilization in Arabidopis lyrata”
适用场景
- 植物生态适应研究：分析Arabidopsis lyrata对岩石、沙地质物的基因组适应机制
- 交配系统进化分析：探究自交/异交转变对生态型形成的影响
- 根系形态功能研究：验证底物适应相关的根系表型差异
- 群体遗传学分析：利用连锁不平衡数据研究自交种群的基因组结构特征
- 生态基因组学关联分析：结合基因组与表型数据挖掘适应性进化的关键基因
