数据集概述
本数据集包含阿塔卡马沙漠线虫18S区域的fasta序列及相关分析文件，属于CRC1211“干旱极限下的地球演化”项目，支持复现“阿塔卡马沙漠土壤生物多样性的层级模式”研究，涵盖生态数据、遗传序列及多样性分析结果。
文件详解
- 核心数据文件：
- FastaSequencesBioDivZenodo.fasta：FASTA格式，包含线虫18S区域的核苷酸序列
- EcolData.zip：压缩文件，可能包含生态相关数据
- 分析结果与表格文件：
- EcoVarData_reprod_transect_testing_fixed.csv、EcoVarData_transect_testing_fixed_feb.csv：CSV格式，包含样带测试的生态变量数据，字段含样带、繁殖方式、经纬度、海拔、气候参数等
- Jaccard_list_corrected.csv：CSV格式，修正后的Jaccard相似性指数列表
- List_of_Families_Genera_Haplotypes_with_accession_20250225.csv：CSV格式，包含线虫科属单倍型及NCBI登录号信息
- nucleotide_diversity_salarstogether.csv：CSV格式，盐沼区域的核苷酸多样性数据
- 遗传分析文件：
- 01_Alaimidae_final_haplotype-matrix.txt等8个TXT文件：TXT格式，单倍型矩阵数据，记录不同位点在样本中的分布
- 04_Acrobeles-like_haptyped_popart.nex等14个NEX文件：NEX格式，用于种群遗传分析的输入文件，如PopART软件的单倍型数据
适用场景
- 土壤生态学研究：分析干旱环境下线虫群落的生物多样性特征
- 种群遗传学分析：探究阿塔卡马沙漠线虫的遗传结构与进化关系
- 环境因子关联研究：揭示气候、地理变量对土壤生物分布的影响
- 生物地理学研究：构建极端环境下生物多样性的层级模式理论
