数据集概述
本数据集包含菲律宾某三甲医院分离的6株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)基因组的注释及耐药基因分析结果,通过Baargin流程完成,含Prokka注释文件和AMRFinderPlus耐药基因分析文件,用于研究MRSA的抗菌药物耐药及噬菌体耐药机制。
文件详解
- Prokka Annotation Files.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含使用Prokka v.1.14.5工具对6株MRSA(TMCC-SA1、-SA3、-SA5、-SA6、-SA8、-SA18)基因组进行注释的相关文件
- AMRFinderPlus_Analysis Results.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:使用AMRFinderPlus v.2024-05-02.2数据库分析6株MRSA基因组中抗菌药物耐药基因的结果文件
数据来源
研究论文“Draft genomes of six Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in a Philippine tertiary hospital with insights on antimicrobial and phage resistance mechanisms”(待发表)
适用场景
- 抗菌药物耐药机制研究:分析MRSA菌株的耐药基因分布及耐药机制
- 医院感染控制:为菲律宾三甲医院MRSA感染的防控策略制定提供基因组数据支持
- 细菌基因组注释方法验证:评估Prokka工具在MRSA基因组注释中的应用效果
- 耐药基因数据库应用研究:验证AMRFinderPlus数据库在临床菌株耐药基因检测中的准确性
- 噬菌体耐药机制分析:结合基因组数据探究MRSA的噬菌体耐药相关机制