数据集概述
本数据集为论文“Bacidia fuscoviridis, another overlooked sorediate crustose lichen widely distributed in temperate eastern North America”的系统发育分析底层文件，包含基因序列比对、分区文件、GenBank登录号对照表及最终系统发育树图，用于分析该物种在Ramalinaceae科内的属级关系，共9个文件。
文件详解
- 基因序列比对文件
- 文件名称：its.nex、mtSSU.nex、LSU.nex、rpb2.nex、combined.nex
- 文件格式：NEXUS
- 字段映射介绍：包含ITS、mtSSU、nucLSU、rpb2单个基因及串联后的多基因序列比对数据
- 串联比对文件
- 文件名称：combined.phy
- 文件格式：PHYLIP
- 字段映射介绍：ITS、mtSSU、nucLSU、rpb2基因串联后的序列比对结果
- 分区文件
- 文件名称：part.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：定义串联序列的分区位置，如DNA,its=1-447、DNA,mtssu=448-1188等
- 对照表文件
- 文件名称：Table 1.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：GenBank登录号与数据集中终端名称的对应关系表
- 系统发育树图文件
- 文件名称：fuscoviridis_phylogeny_figure.tif
- 文件格式：TIFF
- 字段映射介绍：系统发育分析得到的最大似然树可视化结果
数据来源
Curtis et al., Journal of the Torrey Botanical Society
适用场景
- 地衣科属分类研究: 分析Bacidia fuscoviridis在Ramalinaceae科内的系统发育位置及属级关系
- 基因序列比对分析: 研究ITS、mtSSU、nucLSU、rpb2基因在系统发育分析中的应用价值
- 系统发育方法验证: 验证多基因串联分析在地衣分类中的有效性
- 生物多样性研究: 支持北美温带地区地衣物种分布及分类的相关研究
- 分类学教学参考: 作为地衣系统发育分析的实例数据，用于生物分类学教学
