找到23个数据集

标签: PHYLIP

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  • MEC_Letsch_Based蜻蜓系统发育与栖息地分化研究数据2016

    2026年1月21日 30 176 98

    数据集概述 本数据集围绕蜻蜓(Anisoptera: Odonata: Insecta)的系统发育与栖息地分化展开,基于8个核基因和线粒体基因,通过模型进化框架分析栖息地使用对分化模式的影响。数据包含序列比对文件及分区方案,用于研究蜻蜓从流水(lotic)到静水(lentic)栖息地的独立殖民化过程,以及栖息地对物种形成速率的影响。 文件详解...
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  • Crotalus_mitchellii_complex_物种界定研究数据

    2026年1月21日 30 146 34

    数据集概述 本数据集围绕斑点响尾蛇(Crotalus mitchellii)复合体的物种界定展开,包含遗传(核DNA、线粒体DNA)、表型和气候相关数据,用于验证气候数据作为生理耐受性替代指标在物种界定中的有效性。通过对比不同数据类型的聚类结果,分析气候数据在物种分类中的局限性,最终为该复合体的分类修订提供依据。 文件详解...
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  • Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据

    2026年1月19日 30 69 8

    数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据,包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件(UCE)基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件,支持趋同演化假说,共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Euctenizidae_Based_北美陷门蛛科系统发育与生物地理学研究数据

    2026年1月19日 30 120 8

    数据集概述 本数据集围绕北美陷门蛛科Euctenizidae展开,包含新属Cryptocteniza kawtak的发现记录,通过锚定杂交富集的系统基因组学方法,重建该科的进化历史,分析属间关系、多样化速率及生物地理分布,探讨灭绝事件对类群分布的影响,为生物多样性保护提供依据。 文件详解 系统发育与进化分析文件...
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  • Struck2015_CurrentBiology_环节动物间隙领域演化研究数据

    2026年1月19日 30 83 53

    数据集概述 本数据集围绕环节动物向海洋间隙领域(沙粒间空间)的演化适应展开,通过系统基因组学方法揭示两类间隙环节动物(Dinophilidae科及Protodrilida和Polygordiidae科)分别通过幼态延续和逐步小型化两种路径适应环境,补充了间隙类群演化机制的研究视角。 文件详解...
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  • TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据

    2026年1月12日 30 161 118

    数据集概述 本数据集为热带东太平洋(TEP)Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据,整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息,用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限,结果支持二者为同一物种。 文件详解 文件名称:Nobia-maf02_SNPS.vcf,格式:VCF...
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  • Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据

    2026年1月15日 30 1 0

    数据集概述 本数据集包含叶蜂与树蜂(膜翅目)系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件,用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史,共包含40个文件。 文件详解 输入文件 文件名称:BEAST_input_phylo-...
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  • Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据

    2026年1月13日 30 155 83

    数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据,包含两种鸟类(马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡)的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据,以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件,用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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  • Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据

    2026年1月13日 30 117 66

    数据集概述 本数据集为水生蝾螈(Necturus maculosus)种群结构与基因流的基因组评估数据,包含美国肯塔基州三个流域(肯塔基河、利金河、金尼科尼克河)的基因组分析相关文件,用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称:bpp.zip 文件格式:ZIP...
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  • Opiliones_Source_历史乙醇保存博物馆标本序列捕获系统发育基因组学研究数据

    2026年1月13日 30 156 36

    数据集概述 本数据集围绕历史乙醇保存博物馆标本的序列捕获系统发育基因组学研究展开,包含35份新鲜标本与15份历史乙醇保存标本(蛛形纲盲蛛目)的超保守元件(UCEs)测序数据,验证了该类标本在现代基因组学研究中的应用价值,涉及基因位点提取、系统发育分析等相关结果文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式)...
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  • Bacidia_fuscoviridis_Based_北美温带地衣科属关系系统发育研究数据

    2026年1月12日 30 60 40

    数据集概述 本数据集为论文“Bacidia fuscoviridis, another overlooked sorediate crustose lichen widely distributed in temperate eastern North...
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  • Hidden_histories_of_gene_flow_Based墨西哥高地鸟类基因组标记数据

    2026年1月7日 30 160 159

    数据集概述 本数据集包含墨西哥高地鸟类(Aphelocoma jays)基因流研究的基因组标记数据,通过4303个超保守元件(UCEs)和2500个SNP位点,结合系统发育树、聚类算法及基因渐渗检测(如ABBA/BABA测试),揭示物种分化过程中的基因流历史。数据支持对物种形成模式的分析,共包含9个相关分析文件。 文件详解 文档文件(.txt)...
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  • 拟步甲科_Staphylinidae_中Creophilus属和Platydracus属线粒体基因组的系统发育分析数据

    2025年12月27日 30 166 86

    数据集概述 本数据集包含鞘翅目隐翅虫科Creophilus属和Platydracus属的首个线粒体基因组相关的系统发育分析数据,涵盖修剪后的矩阵、分区文件、扩展共识树及补充表格,用于支持该类群的系统发育关系研究。 文件详解 数据集压缩包(Datasets.zip)...
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  • 新西兰溪流鱼类延迟适应性辐射研究数据集

    2025年12月20日 30 153 100

    数据集概述 本数据集围绕新西兰Gobiomorphus鰕虎鱼的适应性辐射展开研究,通过系统基因组数据结合贝叶斯方法,分析其分化时间、形态特征演化与物种形成的关系,揭示适应性辐射在无竞争谱系环境下的缓慢启动现象。 文件详解 该数据集包含17个文件,覆盖分析结果、补充材料、配置文件等,具体说明如下: - 结果图表文件: -...
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  • 胡萝卜沿海亚种变异基因型测序数据集

    2025年12月23日 30 15 11

    数据集概述 本数据集聚焦胡萝卜属(Daucus)中沿海"gummifer"形态型亚种的遗传变异,通过基因型测序(GBS)分析288份样本,涵盖地中海、大西洋沿岸及巴利阿里群岛等区域,识别出29041个过滤后的单核苷酸多态性(SNPs),为该类群的分类与系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 图表文件: -...
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  • RefPlantNLR实验验证植物NLR数据集及脚本20200528_415

    2025年12月23日 30 196 95

    数据集概述 该数据集是RefPlantNLR的补充资料,包含经实验验证的植物NLR(核苷酸结合寡聚化结构域样受体)相关序列、注释及分析结果,涵盖氨基酸序列、CDS序列、基因组序列、结构域注释、系统发育树等多类型数据,为植物免疫研究提供基础数据支持。 文件详解 该数据集包含补充表格和数据集文件,具体说明如下: - 补充表格文件: -...
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  • 树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019

    2025年12月23日 30 150 30

    数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料,包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等,为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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  • 蟒科系统发育与形态进化数据集

    2025年12月22日 30 53 32

    数据集概述 本数据集围绕蟒科(Pythonidae)的系统发育、生物地理和形态测量学研究展开,包含系统发育分析数据、形态学测量数据、分类器文件及补充信息文档,支持解析蟒科起源、扩散历史及形态多样化机制的研究,为理解生态机会促进形态演化提供数据支撑。 文件详解 该数据集包含8个文件,具体说明如下: - 文档与补充信息文件: -...
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  • 隆头鱼亚目咽颌进化系统发育与功能评估数据集

    2025年12月15日 30 59 23

    数据集概述 本数据集围绕鲈形目隆头鱼亚目咽颌(pharyngognathy)这一关键演化创新展开,包含基于188种棘鳍鱼类10个核基因座的系统发育分析结果,以及咽颌功能形态学调查数据,旨在探究咽颌的演化历史与多样化机制。 文件详解 文件名称:labroidALL.nex 文件格式:NEXUS(.nex)...
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  • 梭鲈丽鱼系统基因组学数据集

    2025年12月11日 30 37 4

    数据集概述 本数据集围绕南美乌拉圭河流域梭鲈丽鱼(Crenicichla)的系统基因组学研究,包含33个物种的基因组数据、系统发育分析结果及生态分化评估数据,揭示该类群快速演化与营养多样化特征,为物种形成机制研究提供支持。 文件详解 图表文件: FIG_S1_existing_hypotheses.pdf:PDF格式,现有系统发育假说示意图...
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