数据集概述
本数据集为水生蝾螈(Necturus maculosus)种群结构与基因流的基因组评估数据,包含美国肯塔基州三个流域(肯塔基河、利金河、金尼科尼克河)的基因组分析相关文件,用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。
文件详解
- 文件名称:bpp.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,可能包含与种群分化历史分析相关的输入或输出数据
- 文件名称:necturus.phylip
- 文件格式:PHYLIP
- 字段映射介绍:包含种群遗传序列数据的系统发育分析格式文件
- 文件名称:necturus.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:变异调用格式文件,记录种群基因组的遗传变异位点信息
- 文件名称:necturus_3pops
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:可能包含三个采样流域的种群划分或基因流分析相关数据
- 文件名称:Suppl stitch script.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:补充脚本说明文档,可能包含基因组数据处理的流程或代码说明
数据来源
论文“A genomic assessment of population structure and gene flow in an aquatic salamander identifies the roles of spatial scale, barriers, and river architecture”
适用场景
- 水生生物种群遗传学研究: 分析水生蝾螈种群结构、基因流模式及分化驱动因素
- 河流生态系统进化研究: 探究河流网络结构对水生物种种群遗传分化的影响
- 基因组数据分析方法应用: 验证参数与非参数方法在种群结构解析中的效果
- 保护生物学研究: 识别孤立种群,为水生蝾螈物种保护策略制定提供遗传依据