数据集概述
本数据集为小巽他群岛飞蜥（Draco属）的系统发育基因组分析数据，包含系统发育、物种界定、种群聚类、生物地理模型测试等相关的输入文件与结果文件，用于研究该属物种的扩散驱动分化、基因流及物种形成机制，共12个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Dryad数据文件的说明文档，关联发表论文信息
- 文件名称：USYB-2021-076_Supplementary_Materials.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含补充方法、补充图表等内容
- 系统发育分析输入文件
- 文件名称：Draco_690Loci_BPP.input
- 文件格式：INPUT
- 字段映射介绍：BPP分析输入文件，含690个基因座数据
- 文件名称：Draco_MYBaits_709loci_120bpProbes_3Xtiling.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：MYBaits探针序列文件，含709个基因座的探针信息
- 文件名称：Draco_collapseBS10_ASTRAL3_MPEST_INPUT.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：ASTRAL3和MPEST分析的输入树文件
- 文件名称：Draco_Partitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：基因分区信息文件
- 文件名称：Draco_AllInfSNP_Adegenet_INPUT.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Adegenet分析输入文件，含所有信息位点SNP数据
- 文件名称：Draco_exon_intron_967361bp.phylip
- 文件格式：PHYLIP
- 字段映射介绍：外显子内含子序列文件，长度967361bp
- 文件名称：Draco_mtGenome_15767bp.phy
- 文件格式：PHY
- 字段映射介绍：线粒体基因组序列文件，长度15767bp
- 文件名称：Draco_FlankingSeq_GPhoCS_Input.aln
- 文件格式：ALN
- 字段映射介绍：GPhoCS分析输入文件，含侧翼序列比对数据
- 压缩包文件
- 文件名称：BioGeoBEARS_input_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：生物地理分析BioGeoBEARS的输入文件压缩包
- 文件名称：STRUCTURE_input_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：种群结构分析STRUCTURE的输入文件压缩包
数据来源
Dryad数据库，关联论文：Reilly SB等2021年发表的“Phylogenomic analysis reveals dispersal-driven speciation and divergence with gene flow in Lesser Sunda flying lizards (Genus Draco)”
适用场景
- 爬行动物系统发育研究: 用于分析小巽他群岛飞蜥的系统发育关系及物种分化时间
- 生物地理模型验证: 基于生物地理分析输入文件，测试地理距离与历史岛屿连接性对物种扩散的影响
- 种群遗传学分析: 利用种群结构分析文件，研究飞蜥种群的遗传结构与基因流
- 物种界定研究: 通过BPP等分析输入文件，验证飞蜥的隐存种与物种边界
- 基因组进化分析: 基于线粒体基因组、外显子内含子序列文件，探究飞蜥基因组的进化特征
