数据集概述
本数据集围绕斑点响尾蛇（Crotalus mitchellii）复合体的物种界定展开，包含遗传（核DNA、线粒体DNA）、表型和气候相关数据，用于验证气候数据作为生理耐受性替代指标在物种界定中的有效性。通过对比不同数据类型的聚类结果，分析气候数据在物种分类中的局限性，最终为该复合体的分类修订提供依据。
文件详解
- 形态数据集文件：
Morph_dataset.csv，格式CSV，包含COLLECTION（采集编号）、NUMBER（个体编号）、STATE（州）、CO（县）、Locality（地点）、LAT（纬度）、LONG（经度）、TAXON（分类单元）、SEX（性别）及POST_GEN_L（左后颊鳞数）、PREFRONTAL（前额鳞数）等20余项形态测量字段
- 线粒体DNA序列文件：
mtDNA_590_bp_ATPase_alignment.fasta，格式FASTA，为590碱基对的ATPase基因序列比对数据
- D统计检验文件：
Dstat_Tests_fasta.zip，格式ZIP压缩包，包含用于D统计检验的FASTA序列文件
- 核DNA SNAPP比对文件：
nucDNA_SNAPP_alignment.nex，格式NEXUS，用于SNAPP分析的核DNA序列比对数据
- 核DNA SNPs结构文件：
nucDNA_1826_SNPs.stru，格式STRU，记录1826个核DNA单核苷酸多态性（SNPs）的结构数据
- 核DNA SNPs比对文件：
nucDNA_2318_SNP_alignment.phylip，格式PHYLIP，包含2318个核DNA SNPs的序列比对数据
数据来源
论文“Limitations of climate data for inferring species boundaries: insights from speckled rattlesnakes”
适用场景
- 物种界定方法学研究：对比遗传、表型与气候数据在物种分类中的表现，验证气候数据作为替代指标的有效性
- 爬行动物分类学研究：基于遗传和表型数据的一致性聚类结果，修订斑点响尾蛇复合体的分类体系
- 生物信息学分析应用：利用核DNA、线粒体DNA序列及形态数据，开展聚类、排序等统计分析
- 进化生物学研究：分析物种间杂交、个体发育等生物学过程对分类信号的影响机制
