保守非外显子元件系统发育基因组学标记数据集

数据集概述

本数据集围绕保守非外显子元件(CNEEs)这一新型系统发育基因组学标记展开,包含16种鸟类及鳄鱼外类群的约3600-3800个基因座数据,对比分析CNEEs与超保守元件(UCEs)、内含子的进化特性及系统发育应用价值。

文件详解

  • Supplementary_FileS7.xlsx:Excel格式文件,可能包含系统发育分析相关的补充数据,如基因座统计、序列变异参数等。
  • Supplementary_Figures_CNEEs_Edwards_2017.pdf:PDF格式文件,包含研究中的补充图表,如系统发育树、序列比对质量对比图等。
  • Supplementary_FileS2.xlsx:Excel格式文件,可能包含标记筛选标准、物种分类信息或进化速率计算数据。
  • Supplementary_Files_Edwards_CNEEs_2017.pdf:PDF格式文件,包含研究方法、结果补充说明或原始分析流程文档。
  • Raw_data_alignments_trees_CNEEs_Syst_Biol.zip:压缩文件,包含原始序列比对数据、系统发育树文件及三种标记类型的对比数据集。

适用场景

  • 系统发育基因组学研究:用于构建鸟类等生物类群的高分辨率系统发育树。
  • 分子进化分析:对比不同非编码标记(CNEEs、UCEs、内含子)的进化速率与变异模式。
  • 标记开发应用:评估CNEEs作为新型系统发育标记的可行性与优势。
  • 生物信息学方法验证:测试序列比对质量、分支分辨率等分析方法的可靠性。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 236.45 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。