数据集概述
本数据集包含BE(2)-C神经母细胞瘤细胞中Brunello全基因组CRISPR敲除文库经拉克罗斯病毒(LACV)存活筛选后的下一代测序(NGS)数据,为研究病毒存活筛选相关基因功能提供支持。
文件详解
该数据集包含5个FASTQ格式的测序文件,具体如下:
- 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/LACV Cont1.fastq,格式:FASTQ,为LACV存活筛选的对照样本1测序数据
- 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/LACV Cont2+3.fastq,格式:FASTQ,为LACV存活筛选的对照样本2和3合并测序数据
- 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/LACV Rep1.fastq,格式:FASTQ,为LACV存活筛选的重复样本1测序数据
- 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/LACV Rep2.fastq,格式:FASTQ,为LACV存活筛选的重复样本2测序数据
- 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/LACV Rep3.fastq,格式:FASTQ,为LACV存活筛选的重复样本3测序数据
适用场景
- 病毒-宿主相互作用研究:分析LACV存活筛选中关键宿主基因的功能
- 神经母细胞瘤基因功能研究:探究BE(2)-C细胞中与病毒抗性相关的基因机制
- CRISPR筛选数据分析:用于全基因组敲除文库筛选实验的测序数据验证与解读
- 病毒感染机制研究:识别影响LACV在神经母细胞瘤细胞中复制或存活的宿主因子