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标签: fastq

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  • Myxomycetes_Based_暗色孢子黏菌遗传条形码物种分化阈值研究数据

    2026年1月19日 30 80 27

    数据集概述 本数据集为暗色孢子黏菌(原生生物)遗传条形码研究的支撑数据,包含基于形态种桑格测序构建的数据库、环境PCR测序原始数据及分析脚本,用于评估18S SSU基因标记的物种注释效果,确定99.1%的种内序列相似性阈值,支持NGS研究中的物种分化分析。 文件详解 代码文件(.py格式) 文件名称:cau.py、cau_fastq.py...
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  • Acanthisittidae_Mitochondrial_Genomes_新西兰棘刺鹩进化史研究数据

    2026年1月2日 30 207 121

    数据集概述 本数据集包含四个新西兰棘刺鹩物种(三种已灭绝、一种现存)的新型线粒体基因组序列,用于解析该科鸟类的系统发育关系并修订分类。数据支持形态学分析与遗传结果的结合,为雀形目早期进化及新西兰生物群研究提供关键遗传信息,助力分子定年及灭绝物种进化历史探究。 文件详解 测序数据文件...
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  • 犬皮肤微生物组PacBio全长16S_rRNA原始测序数据集

    2025年12月14日 30 47 16

    数据集概述 本数据集包含12只健康金毛寻回犬皮肤拭子样本的PacBio HiFi长读长fastq原始测序文件,样本取自腋窝和腹股沟区域,于口服益生菌/后生元补充剂第0、30、90天采集,用于研究其对犬皮肤微生物组的影响。 文件详解 文件名称: Canine_skin_microbiota.zip 文件格式: ZIP压缩包(.zip) 内容说明:...
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  • 软腐果胶杆菌科物种复合体β_内酰胺酶相关16S与gapA测序数据集

    2025年12月13日 30 208 74

    数据集概述 本数据集包含用于研究软腐果胶杆菌科(SRP)物种复合体β-内酰胺酶的16S和gapA基因Illumina测序数据,以及样本名称说明文档,为相关微生物分子研究提供基础数据支持。 文件详解 16S.fastq.tar:压缩文件,包含16S基因的Illumina测序原始数据(fastq格式)...
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  • iPSC来源内皮细胞rs9349379位点编辑RNA测序数据集AA1_AA2

    2025年11月29日 30 93 48

    数据集概述 该数据集包含对iPSC来源内皮细胞(ECs)在rs9349379位点编辑后的RNA测序(RNA-seq)数据,涉及AA1和AA2两个样本,为研究该基因位点编辑对基因表达的影响提供原始测序数据支持。 文件详解 原始测序文件(均为fastq格式): AA1.R1.fastq:AA1样本的测序读段1文件...
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  • 葡萄与黑麦根系丛枝菌根真菌Illumina_MiSeq原始序列数据集

    2025年11月29日 30 92 5

    数据集概述 本数据集包含葡萄与黑麦根系丛枝菌根真菌群落的Illumina MiSeq原始序列数据,基于核糖体DNA基因的部分LSU区域测序,共三十个文件,均为FASTQ格式,存储于单个目录下。 文件详解 该数据集由一个目录下的多个FASTQ文件组成,具体说明如下: - 目录: Illumina samples 1-15/(包含全部三十个文件) -...
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  • RNA_seq_GG3_iPSC内皮细胞基因编辑转录组测序数据

    2025年11月27日 30 19 1

    数据集概述 本数据集包含对rs9349379位点进行基因编辑的iPSC(诱导多能干细胞)来源内皮细胞(ECs)的RNA测序原始数据。数据由两个配对的FASTQ格式测序文件组成,分别代表测序读段的正向和反向序列,用于分析基因编辑对细胞转录组的影响。 文件详解 RNA测序原始数据文件 文件名称: GG3.R1.fastq、GG3.R2.fastq...
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  • BE_2_C神经母细胞瘤细胞Brunello全基因组敲除文库LACV存活筛选数据集

    2025年11月28日 30 60 36

    数据集概述 本数据集包含BE(2)-C神经母细胞瘤细胞中Brunello全基因组CRISPR敲除文库经拉克罗斯病毒(LACV)存活筛选后的下一代测序(NGS)数据,为研究病毒存活筛选相关基因功能提供支持。 文件详解 该数据集包含5个FASTQ格式的测序文件,具体如下: - 文件名称:Brunello Whole Genome Knockout...
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  • AA基因型诱导多能干细胞来源内皮细胞RNA测序数据集

    2025年11月27日 30 182 134

    数据集概述 本数据集为AA基因型诱导多能干细胞来源内皮细胞(iPSC-ECs)的RNA测序(RNA-seq)原始数据,包含一个FASTQ格式的测序文件,用于基因表达相关分析。 文件详解 文件名称:AA1.R2/AA1.R2.fastq 文件格式:FASTQ(.fastq) 内容说明:AA基因型iPSC-ECs样本的RNA-...
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  • 干细胞衍生内皮细胞RNA测序数据_GG2样本

    2025年11月27日 30 137 128

    数据集概述 本数据集包含源自干细胞的内皮细胞(样本编号GG2)的RNA测序原始数据。数据由成对的测序文件组成,采用标准的FASTQ格式,适用于基因表达分析和转录组研究。数据集结构简单,包含两个互补的测序读段文件,为研究干细胞向内皮细胞分化过程中的基因表达特征提供基础数据支持。 文件详解 GG2.R1.fastq 文件格式:FASTQ...
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  • 纳米孔18S_rRNA扩增子测序低读数分类数据集

    2025年11月27日 30 36 30

    数据集概述 本数据集包含通过纳米孔18S rRNA扩增子测序获得的低读数(少于二十条)样本的分类学注释结果,经Kraken2识别后,通过BLAST against NCBI核苷酸数据库验证,保留用于探索性研究,以检测稀有或潜在新分类群及其可能的分布区域。 文件详解 该数据集包含一个目录下的十四个FASTQ格式文件,具体如下: - 目录名称:Low...
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  • 急性热应激下青年母鸡盲肠_microbiota_16S测序数据集

    2025年11月26日 30 185 83

    数据集概述 本数据集为急性热应激下青年母鸡盲肠微生物群的16S测序数据,基于饲喂不同剂量绿原酸(CGA)的青年母鸡热应激实验,通过Illumina Miseq平台测序获得,包含二十个样本的测序文件,用于研究CGA对热应激母鸡肠道菌群的影响。 文件详解 该数据集包含一个目录下的二十个文件,具体说明如下: - 目录名称:16S sequenceing...
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