数据集概述
本数据集包含通过纳米孔18S rRNA扩增子测序获得的低读数（少于二十条）样本的分类学注释结果，经Kraken2识别后，通过BLAST against NCBI核苷酸数据库验证，保留用于探索性研究，以检测稀有或潜在新分类群及其可能的分布区域。
文件详解
该数据集包含一个目录下的十四个FASTQ格式文件，具体如下：
- 目录名称：Low read counts from Nanopore 18S rRNA amplicon-ba/
- 文件类型：所有文件均为FASTQ格式（.fastq）
- 文件示例：
- flow_cell_1_barcode24_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_1_barcode28_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_1_barcode46_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_2_barcode70_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_2_barcode01_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_1_barcode66_classified_above_threshold.fastq
- flow_cell_1_barcode34_classified_below_threshold.fastq
- flow_cell_1_barcode63_classified_below_threshold.fastq
适用场景
- 微生物多样性研究：探索低丰度或潜在新分类群的存在及其分布
- 分子生态学分析：研究未充分探索区域的生物群落组成
- 测序方法验证：评估Kraken2与BLAST在低读数样本分类中的一致性
- 寄生虫学研究：分析血寄生虫的隐藏多样性
- 生物信息学方法开发：优化低覆盖率测序数据的分类学注释流程
