数据集概述
本数据集提供北美两种蛙类（ Lithobates clamitans 和 Pseudacris regilla ）的转录组资源，含mRNA测序组装结果、抗菌肽注释及系统发育保守位点信息，支持比较基因组学、基因表达分析及分子标记开发。
文件详解
- 文档类文件：
- README_for_Lithobates.clamitans.annotation.xls.txt：TXT格式，数据集说明文档
- Conserved signal peptides of AMPs.pdf：PDF格式，抗菌肽保守信号肽相关文档
- Summary-figure-of-nucleotide-distance-conserved-regions.pdf：PDF格式，核苷酸距离保守区域汇总图文档
- 表格类文件：
- Lithobates.clamitans.annotation.xls：XLS格式，Lithobates clamitans 注释表格
- Pseudacris.regilla.annotation.xls：XLS格式，Pseudacris regilla 注释表格
- 3-way-orthologs.xls：XLS格式，三物种直系同源基因表格
- conserved-primer-candidates-for-orthologous-segments.xls：XLS格式，直系同源片段保守引物候选表格
- 序列类文件：
- Rana-assembly.fasta：FASTA格式，蛙属物种组装序列
- antimicrobial-peptide-clusters.fasta：FASTA格式，抗菌肽簇序列
- 3-way-aligned-orthologous-segments.fas：FAS格式，三物种直系同源片段比对序列
- antimicrobial-peptide-cluster-reads.fas：FAS格式，抗菌肽簇读取序列
适用场景
- 比较基因组学研究：分析两种蛙类转录组差异与进化关系
- 免疫因子研究：挖掘和分析两栖类抗菌肽等免疫相关基因
- 系统发育分析：利用保守位点开发核基因分子标记
- 种群遗传学研究：基于保守引物开展种群遗传多样性分析
- 基因表达分析：为定量基因表达研究提供基础数据支持
