北美西部本土丛生禾草_沙生针茅_精细尺度空间遗传结构数据集

数据集概述

本数据集聚焦北美西部本土丛生禾草沙生针茅(Achnatherum thurberianum),通过简化基因组测序获取17个种群246个个体的5677个SNP位点数据,分析其种群遗传结构、进化历史及环境适应性,为恢复规划提供参考。

文件详解

  • README.md:Markdown格式说明文档,概述数据集内容,包括最终修剪的VCF文件、系统发育树文件及支撑研究发现的HTML脚本说明。
  • Landscape-genetics-of-Thurber-s-needlegrass.html:HTML格式文档,包含支撑本研究发现的分析脚本。
  • acth.treefile:系统发育树文件,存储由IQ-TREE生成的原始系统发育树数据。
  • acth.vcf:VCF格式文件,包含沙生针茅种群的单核苷酸多态性(SNP)数据。

适用场景

  • 植物遗传学研究:分析沙生针茅种群遗传结构、进化历史及交配系统对种群分化的影响。
  • 生态适应性研究:探究环境变量对沙生针茅遗传变异空间分布的驱动作用。
  • 恢复生态学应用:为沙生针茅自然群落恢复规划中种子区划分及种群选择提供依据。
  • 进化生物学研究:解析沙生针茅在大盆地复杂的进化历史及地理种群关系。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 16.21 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。