数据集概述
本数据集围绕被子植物科内快速辐射类群的系统发育重建问题，以莎草科的Carex族-Dulichieae族-Scirpeae族分支（CDS分支）为测试案例，提供了基于461个保守核基因的锚定富集数据及相关分析结果，用于解决因快速辐射导致的系统发育主干弱支持或未解决问题。
文件详解
- 文件名称: P0082_Final_NGS_matrix.nex.zip
- 文件格式: ZIP压缩包（.zip）
- 内容说明: 包含461个核基因的NGS矩阵数据，采用NEXUS格式，用于系统发育分析的核心数据集
- 文件名称: onlineAppendix4--MLtree.pdf
- 文件格式: PDF（.pdf）
- 内容说明: 基于最大似然法（ML）分析得到的系统发育树结果
- 文件名称: onlineAppendix3--MPtree.pdf
- 文件格式: PDF（.pdf）
- 内容说明: 基于最大简约法（MP）分析得到的系统发育树结果
- 文件名称: onlineAppendix2--saturationPlot.pdf
- 文件格式: PDF（.pdf）
- 内容说明: 序列饱和分析图，展示不同分子标记的进化饱和程度
- 文件名称: onlineAppendix1--locus_characteristics.xls
- 文件格式: Excel表格（.xls）
- 内容说明: 基因座特征数据表，包含461个核基因座的基本信息和统计特征
适用场景
- 系统发育学研究: 用于被子植物科以下类群快速辐射事件的系统发育重建，验证核基因数据集对短分支节点的解析能力
- 分子进化分析: 比较核基因与质体基因、核糖体DNA标记的系统发育信息含量，研究基因树冲突与系统发育准确性的关系
- 植物分类学修订: 为莎草科CDS分支的分类学修订提供分子系统发育证据
- 锚定富集技术应用: 评估保守核基因锚定富集探针在解决快速辐射类群系统发育问题中的有效性
