数据集概述
本数据集为阿拉斯加基奈半岛桦树(Betula)的全基因组测序数据,旨在探究1899年被描述后身份仍存疑的Kenai桦树(Betula kenaica)的物种信息。包含2019年8月采集的2份桦树标本(BK01为Betula kenaica、BP01为Betula pendula subsp. mandshurica)的测序相关文件,共5个文件,涉及标本采集数据、提交表单及测序结果。
文件详解
- 标本采集数据文件
- 文件名称:ArctosData_FD21DD1178.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含USE_LICENSE_URL(使用许可链接)、GUID(标本唯一标识符)、SCIENTIFIC_NAME(学名)、COUNTRY(国家)、STATE_PROV(州省)、SPEC_LOCALITY(具体采集地)、DEC_LAT(纬度)、DEC_LONG(经度)等标本采集相关字段
- 测序样本提交表单
- 文件名称:Bowser_submission_form_Betula_genomes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:桦树基因组测序的样本提交表单,具体字段未提供预览
- 基因组测序结果文件
- 文件名称:MB_BK01.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:Betula kenaica(BK01)的基因组序列文件
- 基因组测序压缩文件
- 文件名称:MB_BK01_refv1.tar.gz、MB_BP01_refv1.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:Betula kenaica(BK01)和Betula pendula subsp. mandshurica(BP01)的基因组相关压缩文件
数据来源
SNPsaurus(Eugene, Oregon, USA)
适用场景
- 桦树物种鉴定研究:通过全基因组测序数据解析Kenai桦树(Betula kenaica)的物种身份及分类地位
- 桦树基因组进化分析:比较Betula kenaica与Betula pendula subsp. mandshurica的基因组差异,探究桦树属物种的进化关系
- 植物标本数字化管理:利用CSV文件中的标本采集数据,完善桦树标本的数字化目录信息
- 基因组测序技术应用:基于测序结果文件,验证全基因组测序技术在桦树等木本植物中的应用效果