数据集概述
本数据集包含Pectobacterium中有时携带blaPEC的区域注释信息。通过提取完整基因组中btsS和glpT之间的DNA序列，使用Prokka（v1.14.5）进行标准参数注释，基因组以原始GenBank组装登录号命名。数据集还包含相关论文系统发育树使用的HTML颜色代码，共295个文件。
文件详解
- 基因环境注释文件（.gbf.gz格式）
- 文件名称：遵循
[GenBank组装登录号]_genetic_context.gbf.gz模式（例如：GCA_003031305.1_genetic_context.gbf.gz）
- 文件格式：GBF.GZ（压缩基因银行格式）
- 字段映射介绍：包含Pectobacterium完整基因组中btsS与glpT之间DNA序列的注释信息，由Prokka生成的标准基因注释内容
- 表格文件（.xlsx格式）
- 文件名称：Table_genetic_context_zenodo.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含相关论文主系统发育树使用的HTML颜色代码指定信息
适用场景
- 微生物基因组学研究: 分析Pectobacterium中blaPEC基因携带区域的基因环境特征
- 细菌基因注释验证: 基于Prokka注释结果验证Pectobacterium基因区域的功能注释准确性
- 系统发育分析辅助: 利用表格中的HTML颜色代码支持相关论文系统发育树的可视化分析
- 基因环境关联性研究: 探索btsS与glpT之间DNA序列区域与blaPEC基因携带的关联机制
