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标签: Prokka

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  • blaPEC_Genetic_Based_Pectobacterium基因携带区域注释数据

    2026年1月13日 30 195 163

    数据集概述 本数据集包含Pectobacterium中有时携带blaPEC的区域注释信息。通过提取完整基因组中btsS和glpT之间的DNA序列,使用Prokka(v1.14.5)进行标准参数注释,基因组以原始GenBank组装登录号命名。数据集还包含相关论文系统发育树使用的HTML颜色代码,共295个文件。 文件详解...
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  • terranigra_dataset_Based_Fictibacillus_terranigra分析数据集

    2025年12月29日 30 8 0

    数据集概述 本数据集包含Fictibacillus terranigra的分析数据,共13个文件,涵盖基因注释、功能预测、代谢分析等内容,涉及blastKOALA、Prokka注释、microtrait筛选、dbcan3分析、DRAM及METABOLIC结果等多种类型文件,可用于研究该菌株的基因功能与代谢特征。 文件详解 基因功能注释文件...
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  • 日本沙壳藻基因组与宏基因组组装数据集

    2025年12月9日 30 207 110

    数据集概述 本数据集包含底栖海洋硅藻日本沙壳藻(Psammoneis japonica)的基因组组装及相关数据,围绕其细菌关联、重复序列驱动的基因组大小进化等研究主题构建,为硅藻基因组学研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:README.txt 文件格式:TXT(.txt) 内容:存储数据集的完整文件列表及描述,为使用者提供文件说明指引...
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  • 口腔微生物液滴测序中间数据集

    2025年12月4日 30 159 86

    数据集概述 该数据集为口腔生物膜的液滴测序中间数据,包含纳米颗粒液滴测序(NP-DS)和细菌细胞液滴测序(Cell-DS)两种技术的分析结果,支持口腔微生物群落结构与功能的研究。 文件详解 P26-28_MV.zip:压缩文件,包含口腔生物膜纳米颗粒液滴测序(NP-DS)结果,内部子目录包括: Contigs:SPAdes组装器生成的最终序列...
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